作者：张涵 中国营养学会

    研究者们正在研发一种非传统的方法来诊断传染病。这种新技术以无假设开始，而不是传统的先猜测病人可能有哪些感染，然后依次逐一检测。

     这种技术需要受感染者的血液或者骨髓液样本，并且研究其所有的DNA，寻找是否有源于病毒，细菌，真菌或者是的寄生虫DNA片段。

     来自the University of California, San Francisco 的科学家报告称他们通过使用这种技术的第一份结果出炉了，但是这依赖于一种叫“下一代测序” （Next Generation Sequencing）的技术。（NGS技术介绍地址：http://res.illumina.com/documents/products/illumina_sequencing_introduction.pdf）

     一名来自SF的21岁女孩Andrea Struve在澳洲内陆旅游了40天后回到了SF，但是却有了一系列疾病症状——大量流汗，发烧，关节疼痛等。对于Andrea的病情，她的主治医生猜测了很多可能的主要原因，但是所有的检测都将猜测否定了。因此医生们将Andrea安排进了UC San Francisco 的一项实验来选用一种不同寻常的方法。

    在这个新的实验中，与以往的诊断检测传染病不同——通常是一次定位在一种感染源，但是这一次检测是测所有的DNA。

    这个项目的负责人 Charles Chiu医生坚持用了这种方法。Charles Chiu医生提取了Andrea 血液里的DNA并在一台高速测序仪上检测（“升级版PCR”）。他将其DNA与DNA库里的所有的感染源DNA样本进行对照，而结果表明Andrea感染于一种与水痘（chicken pox）相关的病毒，其通常引发小鸡中的蔷薇疹（roseola rash ）。

     医生们其实还不完全确定为什么Andrea会感染到这种病毒。但是Andrea现在痊愈了，她的这一病例这周被在线发表于the  journal Genome Research, 线上详尽描述了此项技术，有兴趣的朋友可以网上查询 （G所有现在受棱镜影响不能给大家链接了。。。）。

    Charles Chiu医生和他的同事们同时也解决了个更严重的案例，在最新一期的New England Journal of Medicine中进行了描述——一个14岁的 Wisconsin小男孩患了脑部感染，又一次医生们排除了他们所能想到的一切普通检测。

     小男孩的病情恶化的特别快，几天之内，医生们得到了样品，并在48小时之内进行了DNA检测，并能检测出一种很有可能引发其感染的微生物。

      怀疑对象叫做钩端螺旋体细菌（图中黄色部分），其在热带很普遍。而这个男孩有免疫缺陷，在一次波多黎各的家庭假期中的游泳后，此细菌附着在小男孩的身上了。小男孩在大强度的 penicillin 治疗后恢复了健康。

       至此，Charles Chiu医生已经将这种技术运用到了30多个案例当中，他和他的同事们已经将25%确认成感染源了。然而他们的所有案例中，其余的根本就不是感染源的问题。

     但是最终这又回到了一个问题，就是这项实验仍然很贵，其在大学的实验环境内完成，每次“跑”DNA序列的费用是1000美金（人力+材料），根本就不包含昂贵的仪器费用。可喜的是这种技术的价格在下降。当然我们希望，当传统的血液检测不能解决问题的时候，这种先进的技术手段能早点现实地派上用场。