要想使用流程管理对企业的管理体系进行整合，解决管理体系孤岛问题，首先要在企业内部构建一个统一的流程管理机构。对于这个流程管理机构，企业可以单独设置，也可以将流程管理的权责交给企业现有的某个部门，而执掌流程管理权责的这个部门就要承担起以流程管理整合企业现有管理体系的责任。

无论是专门的流程管理机构，还是被赋予流程管理权责的部门，其主要任务不是设计企业的业务流程，而是以流程管理对企业现有的管理体系进行整合，使其实现规范化。

企业供应链管理咨询组织想要改变发货流程，在实行流程管理之前，该组织可以直接将修改之后的流程交由发货部门，要求发货部门更改。

而在实行流程管理之后，供应链管理组织首先要向流程管理部门递交发货流程更改申请，流程管理部门收到申请之后，将与发货流程变更有关的人员汇集到一起对发货流程变更方案进行协商。在各部门人员针对发货流程更改这一问题达成共识之后，流程管理部门统一下发货新流程，并对新流程的执行情况进行监督。

通过这种方法，企业管理体系孤岛问题能得以有效解决，新流程的执行情况也能得以有效保证，可谓是一举两得。

如果企业不单独设立流程管理机构，那企业的哪些部门能承担流程管理职责呢？从现实情况来看，企业通常会将流程管理职责赋予企管部、内控部及ＩＴ部这三个本身就能进行全局管理的组织，具体分析如下。

（1）企管部的主要职能就是制定各种规章制度及考核体系，企业管理咨询顾问帮助企业实现规范化管理，在体系整合方面具有先天优势。基于此，企业将流程管理及体系整合职责赋予该部门也理所应当。

（2）随着信息化管理系统在企业的普及应用，ＩＴ系统与企业管理体系不断融合，ＩＴ部门也与企业战略目标的实现过程及战术计划的应用过程逐渐融合。在这种融合趋势出现之后，很多企业都对ＩＴ部门进行了重新定位，赋予其流程管理职责，将其更名为“流程及信息管理部”。

（3）企业内控部门成立的主要目的就是对企业风险进行全面管理，对企业各种管理体系进行风险控制是其职责之一。因此，有的企业也将流程管理交由该部门负责，如中石油等。