[转载]QRT-PCR算法
(2013-06-26 10:34:13)
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分类: 学术 |
QRT-PCR 方法
95℃预变性2min,然后进行以下循环;94℃变性15sec,55℃退火15sec,68℃延伸30sec,共进行45个循环,最后65-95℃制备溶解曲线。
选择actinA为内参基因,每个样品做三个重复,用2-△△Ct 法对样本基因进行表达差异相对定量分析。△△Ct=(CT target–CT actinA) 待测样本–(CT target–CT actinA) 校准样本 ,在本研究中我们选择每个基因在接种第一天中的表达为校准样本,第3、5、7天为待测样本。例如:
|
样本名称 |
Gene1 Mean(Ct) |
actinA |
△Ct |
△△Ct |
2-△△Ct |
|
1 |
27.35 |
16.98 |
10.37 |
0 |
1 |
|
2 |
27.52 |
16.86 |
10.66 |
0.29 |
0.82 |
以1号样本为校准样本,2号为待测样本,应用△△Ct法进行分析:
第一步,应用参照基因对校准样本和待测样本进行校正:
△Ct(校准样本) = Gene1(Mean Ct)1-参照基因actinA (Mean Ct)1
△Ct(待测样本) = Gene1(Mean Ct)2-参照基因actinA(Mean Ct)2
第二步,校准样本和待测样本的△Ct 进行归一化:
△△Ct= △Ct(待测样本)-△Ct(校准样本) =10.66-10.37=0.29
第三步,表达差异计算:
2-△△Ct = 2-0.29 =
因此2号样本的Gene1的表达水平比一号低0.82倍。

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