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分类: 学术

华大基因(BGI)于1999

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华大基因(BGI)于1999

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分类: 分子水平的自然选择


1:admixture的输入为:PLINK (.bed),

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分类: 学术
# coding:utf-8
# Email:fanyucai1@126.com
# 2018.3.15

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分类: 学术
原文地址:关于结构变异作者:fanyucai
1:关于结构变异分析的一篇综述性文件,感觉这篇文献最大的特点就是在末尾依据不同的分析软件对SV不同类型的检测分类:
Guan P, Sung W K. Structural variation detection using next-generation sequencing data: a comparative technical review[J]. Methods, 2016, 102: 36-49.
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分类: 学术
数据分析管道:SALSA2(https://github.com/machinegun/SALSA)
之前的以前分析管道还有:3D-DNA以及LACHESIS

特点:可以矫正组装错误,可以输
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文献名称:Genome-wide association study using whole-genome sequencing rapidly identifies new genes influencing agronomic traits in rice
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参考链接:
http://www.gettinggeneticsdone.com/2014/05/qqman-r-package-for-qq-and-manhattan-plots-for-gwas-results.html
1:主要是使用qqman
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原文地址:GWAS学习笔记之基础8作者:fanyucai

什么是GWAS?

GWAS分析方法的原理是,在全基因组范围内选择
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原文地址:GWAS文献阅读5-芝麻作者:fanyucai
1:英文题目:2015-Genetic discovery for oil production and quality in sesame 
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