新疆是我国的棉花主产区之一，丰富的光热资源、优越的水利灌溉条件、相对充裕的土地资源，使棉花生产具有巨大的发展潜力。1996年全疆棉花播种面积79.93万公顷，总产94.04万吨，分别占全国的16.9和22.4%，总产居全国各省(市、区)之首。其中，塔里木盆地在棉花产量和品质方面均具有明显优势，棉田面积和产量都占全疆的60%以上，长绒棉产量约占全疆的90%。当前，新疆棉花生产面临的主要问题有：长期连作导致病虫害加重，大水漫灌造成水资源浪费，地膜覆盖造成土壤污染，以及土壤次生盐渍化、劳动力短缺、加工业不配套等。今后应在稳定现有棉花种植面积的同时，注重抗病、抗虫棉品种的选育，建立合理的轮作制度，积极推行新型节水灌溉技术，研制、使用低污染的覆盖材料，加强盐碱土改良，全面发展机械化耕作与采收，大力发展现代棉纺工业，以迎接新的世界市场机遇。同时，搞好棉花秸秆和棉籽的综合加工利用，进一步促进相关产业的发展。新疆棉花生产基地产业链的建设，将对实现我国棉花产需平衡、改善棉花品质和提高棉花生产效益发挥重大作用。现代农业看新疆，新疆棉业率先行。西部大开发，新疆棉花基地建设立首功。