犬甲状腺机能减退最常见的临床病理学表现是高胆固醇血症和高甘油三酯血症。约75%甲状腺机能减退患犬可见高胆固醇血症，且有时胆固醇浓度可超过1000mg/dl。虽然禁食性高胆固醇血症和高甘油三酯血症也可能出现于其它几种疾病，但若存在相应的临床症状很可能表明患有甲状腺机能减退。

    轻度正细胞正色素性非再生性贫血（红细胞压积[PCV]28%~35%)并不常见。检查红细胞形态时，可见靶细胞数量增加，这是红细胞膜胆固醇含量增加引起的。白细胞数一般正常，血小板数正常或增加。

    乳酸脱氢酶、天门冬氨酸氨基转移酶、丙氨酸氨基转移酶、碱性磷酸酶轻度或中度升高，而肌酸激酶偶见升高，但这些并不持续存在，与甲状腺机能减退并无直接联系。一些先天性甲状腺机能减退患犬可见轻度高钙血症。甲状腺机能减退患犬的尿液分析结果通常正常。多尿、低渗尿和尿道感染也不是甲状腺机能减退的典型症状。

    皮肤病理学检查  对于怀疑患有内分泌性脱毛的犬，通常会进行皮肤活组织检查，特别是其它检查（包括甲状腺功能检测）未能找出病因时。包括甲状腺机能减退在内的各种内分泌疾病，会出现非特异的组织学变化，有时也可见甲状腺机能减退特异的组织学变化。存在继发性脓皮症时，可出现不同程度的炎性细胞浸润。当发现甲状腺机能减退特异的组织学变化时，需要进一步检查甲状腺功能。