师瑜伽总摄显密从因地直至果位之法，亦自然涵盖五加行。五加行从皈依开始，为佛教一切修法之基础，通过五加行之如法修学，可以圆满成就之法器，为后续正行修法奠定基础，故此法极为重要，乃初学者入门必修之法。自宗传统修法亦强调需修完五加行后方可修持正行。
然诸多在家居士常有疑虑：面对现实生活与日俱增的压力和五加行庞大的数量，若难以在短期内完成五加行之修学，趋入正行修法岂不变得遥遥无期？故有 者因心生畏惧而放弃修法，有者虽坚持修满五加行之数量，然因不知五加行修学之目的及意义，仅求完成数量而忽视内心之调伏，徒有凑数之虞。如《功德藏》中 云：“只顺善恶意差别，不顺善恶相大小。”故善法功德不取决于数量多寡而在内心之调柔。如有些显宗修行者已修行多年，非如一无所知之初学者，其无论从皈 依、忏悔、发菩提心等均已行持，虽无五加行之修法形式，但内心业已调柔，堪称法器，可直接趋入正行。若仍执著教条，不论根机，均从五加行开始，则有误机之 过失。以上均有悖于修持五加行之初衷。故我等大恩根本上师妙音龙多加参仁波切曾就此开示曰：“按照传统修法要求，修行者必先修完五加行，方可讲解修持正行 之方便。然法无定法。如今汉族居士，置身现实社会，客观上难以如是照行，倘若对密宗具有坚定信心，往昔亦行诸多善法，也可为其讲解正行，以速疾趣入解脱正 途为要。”诚然，若条件具足，如法修持五加行功德不可思议。我等历代传承祖师即便在恶劣环境下仍依次第修行成办解脱，如华智仁波切曾听闻二十五遍加行引 导，而修二十五遍五加行等。如今烦恼炽盛的我等众生，更应励力照行为要。上师瑜伽已含摄五加行之全部要义，如下详述。