关于玄秘塔宋拓本的校碑，有宽严两道：基本上，宽者定北宋拓之本，严者只算宋拓；而宽者定南宋拓之本，严者则记为明早拓。各种记述间互有错漏、含混甚至自相矛盾之处，易成误解。断代之事，其实亦全出后人猜测，以其代表性特征划分时代界限。我们的使命不该只执着于一个定名，更重要的是厘清脉络，整理同于不同的前后次序。

在新中国已出印本中，有五本基本为同一时代所拓，考据极为近似，兹忠实记录如下：
- 首行“三教谈论”“三”字余一横
- 首行“安国寺上座”“上”字完好
- 三行“上柱国”“国”字中已泐
- 四行“大法师端甫灵骨之所归”“甫”字下角泐损，“灵”字末横可见右半
- 九行“雨甘霖于法种者”“种”字仅末横微损，呈弯曲状
- 十四行“而天子端拱无事”“事”字完好
- 十七行“指净土为息肩之地”“指”字。此字可能为往昔记述最大之错讹处，皆云北宋本匕部完好，其实此五本中北京文物商店本、孔广陶本、罗振玉本匕部竖笔左侧均明显有描（并殃及笔划），另两本王存善本、徐渭仁本此处亦不洁净，且匕部左同有石花显现。倒推未描前样貌，应是此时竖笔已微泐（连石花），通过填描强将笔划与石花分开，但此外匕部其他笔划完好。
- 廿五行“为作霜雹”“霜”字石泐痕仅连及木部左撇和目部右下角，“雹”字仅损上横
- 末行“会昌元年十二月”“十”字完好
- 末行“邵建和”“建”字基本完好

凡符合以上条件者，皆可列此阵营，名宋拓抑或北宋拓均相差不远矣。此五本的印本分别有：

1、北京文物商店藏本：内无藏印，可能即为《善本碑帖录》中所载之宋装本。与其他四本比较，“三”字似隐约可见中横，石花也略小些。仅见一印本——90年代日本同朋舍“中国石刻大观”黑白大16开经折装册页，略缩小精印。

2、现藏北京故宫的王存善本：新中国后几乎一统国内出版天下的善本。最佳印本当属文物出版社60年代的黑白8开线装珂罗（这也是文物珂罗碑版中摄影质量最高的一册），原色印本（非人工做色的）唯见21世纪故宫出版社“历代法书碑帖经典”8开，其他佳者另有80年代文物“中国书法”柳公权卷第二册黑白8开、21世纪文物蓝皮黑白8开（简装与线装两种），其次是二十一世纪上海书画出版社“中国书法宝库”黑白16开，再次是60年代北京出版社、70年代文物出版社、80年代上海书画出版社《书法自学丛帖》正书（中册）、90年代西泠印社“法帖丛编”前后四版黑白12开以及二玄社“书迹名品丛刊”黑白大12开，再下有80年代文物“历代碑帖法书选”黑白16开（经照片重新割配改作每行6字，为了临习方便进行了修描，原貌已损）和上海书画出版社21世纪“中国碑帖经典”黑白大16开（翻印时拍摄不佳，个别页有模糊现象），80年代北京出版社以黑白16开再版如石印风神尽失，其他翻印本无数，几无可观。

   

注：珂罗版是略缩小的，北京出版社和70年代后的文物均用的同一套版翻制，因此比例一样。而中国书法是重新摄影制版的，原大，且摄制风格与珂罗系迥异，应是用了滤色片的。如珂罗系都是印章为暗色，而中国书法的印章为亮色。此珂罗版质量极佳，细节力还是非胶版或凹版可比。

3、现藏日本三井的孔广陶本：最佳印本为二玄社80-90年代“中国法书选”黑白大16开，也略缩小，其次是各种国内翻印本，以下不计。

4、现藏上海图书馆的徐渭仁本：最佳印本为上海书画出版社21世纪“法书至尊”原色大12开蝴蝶装册页，原大极精；另有上海书画出版社21世纪“中国碑帖名品”原色大12开，亦原大。

5、现藏辽博的罗振玉本：仅见辽宁美术出版社60年代的黑白16开，缩小较多。

玄秘塔的复杂处在于后世经重剜，许多考据点新拓甚至超过旧拓（如“三”字近拓甚至三横皆可见），而以红色标出之处则未剜，可用以有效区分新旧。

时代介于南宋、明初之间的拓本见传有三本：现藏上图的龚心钊残本、现藏国图的杨尚文本和和现个人藏的孙多瓛本。

经过多本比对，发现《增补校碑随笔》中一些南宋拓考据差异是完全从孙多瓛本（嘉德2016年秋拍276万成交，民国商务印书馆曾印，新中国后有上海画报出版社21世纪“中国历代碑帖”黑白大16开与上博黑白线装自印珂罗本）而来，如六行“及诞”“诞”字、十三行“缚吴干蜀”“蜀”字，本中这些字看来各有特殊状况，与拓工、纸损、填描均有关系，之前之后的拓本均显示完好，迄今无其他旁证这几处差异于南宋时确实存在。另有几处是孙本明显填描，如“国”字、“甫”字。此本拓墨湮失、剪裱极乱，面貌一派骨瘦，已去宋本远甚，其他考据处全落下风，本帖即不细表。

龚心钊残本前后缺七开（“唐故”至“其音”五开、“驾横”至“六日”一开、“无心”至“初镌”一开），所缺部分用明末清初的拓本补全。而杨尚文本拓墨一致，精洁喜人，应更适合作为标准件。两本相当处有“三”字（余一横但石花较大）、“十”字（横肩上略损）、“建”字（内与末笔略损）；龚本填描处有“种”字（杨本损末二横）、“指”字（杨本匕部各笔皆损，扌部提笔亦损）；杨本胜处有“上”字（杨本完好，龚本已泐）、“灵”字（杨本似隐约可见末横右半，龚本仅略见末横下沿），均为龚本后补所致；龚本胜处有“事”字（龚本无损，杨本损口部左半）、“雹”字（龚本仅损上横，杨本上雨部涂黑）。可见龚本原在杨本之前，更近北宋，但两本均不失宋本的爽利字口与骨肉匀称，非明后之拓可比。记下印本：

1、龚心钊残本：仅见上海书店60-90年代的黑白12开，缩小，似以私摄的老照片制版，摄影不佳。

2、杨尚文本：最佳印本为中华书局21世纪“三名碑帖”原色大8开，原大；另有西泠印社21世纪木夹子“碑帖善本精华”原色册页本。

另，传说上博还有同为龚氏藏“三”存两画的早宋拓本，不知为何未见出版（而下几档次的孙本却已出版多次）？