佛界一些神秘之处至今不能解释。比如“舍利子”。修行达到一定程度的和尚圆寂之后火化，会在骨灰里找到如同小珍珠一样的五彩的“舍利子”， 在泰国见到好多，那是什么物质？没有人能用现代科学仪器分析它的成分，所以也说不清楚。

    十四世达赖在自己的自传里说，Dr. Herbert  Benson  博士找到一些高段禅修行者做了科学实验，发现了某些奇特的现象，实验结论发表在了《自然》杂志上。他用肛门温度计和皮肤温度计测量拙火瑜伽行者的生理变化，发现他们在练功之后体温升高了10度，那些和尚们能烘干披在他们身上的湿的床单。他们可以在室外零下温度的环境里赤身坐在雪地里打禅，整夜没有失温，行者的呼吸次数降低到一分钟7次左右。他认为是修行者的心理过程在燃烧体内的一种“棕色脂肪”，过去认为，只有冬眠的动物才会有这种现象。

     另外，还有“神谕”、“转世”，西藏的佛教徒们都深信不疑。