喀纳斯景区位于阿尔泰山地地貌与植被垂直带，自高向低，海拔3000m以上为现代冰川与永久积雪覆盖的高山冰雪寒冻带、海拔2400—3000m为冰缘亚高山寒冻苔原垫状草甸带、海拔1300—2400m为中山寒温针叶林草原带（由针叶树种西伯利亚落叶松、西伯利亚冷杉、西伯利亚云杉、西伯利亚红松组成）、海拔800—1500m为低山丘陵灌木草甸草原带、海拔800m以下是山前冲洪积平原绿洲荒漠带，垂直分层明显，可饱览阿尔泰山6－7个垂直自然景观带的真貌。