在江西与安徽接壤的地区，4月份的形势有所变化。由于太平军的活动已经逼近浙江，浙江巡抚何桂清不得不插手安徽东部边境的军务，派知府石景芬率领浙江清军，会同安徽各地民团，攻打歙县和休宁。

    太平军从黟县南下两百里，进入江西东北角的婺源。这时，向荣从江南清军中派出邓绍良和周天受，率领援军从浙江出发，会同浙军攻克婺源。太平军返回安徽，撤退到祁门西北一百多里处的石埭。

    与此同时，在婺源以南两百多里处，太平军攻占了弋阳。罗泽南率部攻打，夺回了这座城市。太平军从原路向东撤退，攻占兴安，再往东进，驻扎广信。罗泽南的部队随后赶到，一战大捷，三天就攻克广信。太平军撤向东北方向的玉山，逼近浙江。于是，江西的湘军占据了饶州。

    在这种形势下，曾国藩觉得鄱阳湖以东有了安全感。他于5月28日离开九江，进驻鄱阳湖北端东岸的南康，距湖口不到一百里。

    他命令萧捷三等人在江西造船，修复内湖水营，由任江西粮道的湖南新化人邓仁坤主持制造。显然，他想在内湖水师恢复元气以后，杀回长江，重建水上优势，打通湖北，并按原计划向长江下游攻击。

    他派特使德英杭布去向陈启迈讨钱筹办火药厂和修船厂，要求陈启迈设法立即拨出二十万两饷银，陈启迈不仅分文不给，还将德英杭布奚落了一番。

    塔齐布率领五千人留驻九江城外，清廷的大臣们议论纷纷。有人认为这支部队停留在这里，没有作战行动，是毫无意义的。但是，多数大臣认为不可放弃对九江的包围，光禄卿王茂荫的意见最为坚决。文宗的意思，也是要塔齐布的部队留在九江，继续围攻。这支湘军与九江和湖口两城的太平军相持，太平军有所忌惮，始终不敢攻击湘军大营。

    同一个月，湖广总督杨霈在湖北也挪了个地方。他从周边已经出现太平军的德安，向北挪了一百多里，逃往离武昌更远的随州。他听说太平军还在北进，连忙派刘长富带兵到长岭岗阻截，结果被太平军打败。太平军继续北上，清廷的西安将军札拉芬赶来增援，战死在德安以北五十里的平林市西边。

    文宗见杨霈如此无能怕死，下诏将他罢官，任命荆州将军官文为湖广总督，常恩代理布政使。

    与此同时，王国才按照胡林翼的部署，率部进攻汉阳，正要修筑军营，太平军前后包抄，一齐杀来。彭玉麟看到陆师被围，下船登岸，变水师为陆师，反过来包抄太平军，一通砍杀，太平军四散逃走。但是，湘军攻占汉阳的企图没能实现。

    湘军水师驻扎在武昌附近，对于太平军而言，犹如骨鲠在喉，于是派出船队从姑塘溯江向上游进攻，重创了湘军水师。

    清军丢失武昌，现在已是第三次了。曾国藩对此十分气愤。他给文宗上疏说，武汉两府一镇，繁华甲天下，总督和巡抚的标兵，荒淫奢侈，怠惰偷懒，不可使用。从咸丰二年太平军打进湖北，到现在不满三年，清军五次大溃败，小溃小败不可胜数。

    曾国藩认为，清廷应该改变以前的做法，改弦更张。凡是要求回归部队的标兵，一概不再接收。凡是曾经溃败的勇丁，一概不予采用。大致说来，偏僻山村的农民，性情粗犷勇悍，水乡的农民则比较油滑。善于用兵的人，爱用山村的勇卒，不爱用城市或水乡的人。如果要在湖北招募编制内的兵员，最好在襄阳和郧县等地的深山穷乡中，招募贫寒劳苦的山民，从中挑选英武猛悍的壮丁，用一些时间加以训练，然后才能得到一支劲旅。

    曾国藩还说，古代谋划大事的人，不会因为攻克一两座名城而高兴，得到一两名良将和几千名精锐的士卒，才会欢喜。不会因为丢失一两座名城而发愁，但若失去一两名良将，折损几十名壮士，就会大为忧愁。至于一支精锐的部队，因为劳累而变得疲软，或者因为缺乏军饷而离散，或者因为不和而骄躁，那就更值得忧虑了。所以，湖北的当务之急是另外招募编制内的兵员与勇丁。目前收复湖北的城市依赖于此，以后保卫湖北的疆土也依赖于此。