中医界反驳的底气不足是得不到现代科学的支持，或者无法用现代科学实验来证明，譬如经络理论，气功等，只能间接证明。面对方舟子之流拿出证据来的叫嚣往往显的反驳无力。

法律上有一种叫证据链的证明方法，也是对直接证据缺失的情况下的事实认定方法。对方舟子的诘问，应当回问一下，证明事物的真实性，现有的可重现的验证方法是唯一的、周全的吗？同理，要否定一个事物的真实性，还必须有一个证伪的程序，未经证伪就否定的做法，本身就有违科学。