我们目前对学科的分类是哲学、自然科学、社会科学、思维科学等。依据研究对象，哲学是研究世界观和方法论的学科，自然科学研究自然界中的物质对象，社会科学主要研究人类社会的现象，思维科学研究人脑思维系统的活动现象。

工具科学。系统论的研究对象是一切系统的普遍规律，横跨自然系统、社会系统和思维系统；进化论的研究对象是包括生物系统在内的某类复杂系统的发展演变规律。因此系统论和进化论都是横断科学，不能简单归类于一个已知分类科学；由于具有先验观点和一定的研究方法，而不是探索观点和方法，因此它们不属于哲学；思维科学是研究人脑思维系统机制的，所以它只能是研究思维系统的工具，是工具科学，而不属于思维科学。数学是许多学科的研究工具，也是工具科学。目前将逻辑学、运筹学归类为数学，这种分类是不正确的，应该将其与数学并列归类为工具科学。针对不同问题使用不同的工具科学，比如在思维科学中，使用数学就不太恰当，而使用进化论的法则会更加有效。

学科状态。学科的本质是思维工具，人们建立了种种学科，就是为了能够更加系统地对不同对象分类，采取不同的方法研究。学科分类过程实际上是研究对象的分类过程。我们知道，从不同的视角出发，我们可以对同一范畴的对象进行不同的分类。比如豆类可以根据品种、颜色、生长区域等进行多种交叉的划分。学科也同样能够进行这类划分。

哲学之所以能够与具体科学进行划分，因为哲学是具体科学的基础。从几个方面能够看到这一点：哲学第一问题是世界的物质性。由此划分出唯心主义和唯物主义。如果建立在唯心主义基础上，就无从具体化其他学科，因为唯心主义是一个动荡不定的平台。唯物主义基础上，又分为辩证唯物主义和形而上学的唯物主义。即世界是一成不变的还是变化发展的。如果用形而上学的唯物主义，世界就不会有渐进的复杂性，这也不符合现实，也无法真正产生有价值的探索。因此辩证唯物主义是哲学的出路，也是科学的出路。唯物是世界观，辩证是方法论，唯物讲求客观性，辩证讲求发展性，由于世界是具有客观性和发展性的，因此正确的哲学观奠定了科学的基础。

从简单到复杂的自然科学分类。自然科学中最基础的学科是物理学，物理学涵盖了很多分支学科，力学又是更基础的物理学，因为能够用最简单几个公式将其描述清楚。光学、电学、声学、机械学、电磁学、流体力学、电子学、凝聚态物理学、量子力学等等，都是建立在不同研究对象和研究方法之上，物理学并不是没有发展空间了，但是物理学的发展速度明显放慢了，因为物理学太具体化了。物理学还是实践性很强的科学，物理学的研究更依赖于实验工具。化学仅仅是宏观层面的学科，化学到了微观，就与物理学同源了，如高分子化学要借助物理学知识。生物学是更加抽象层次的学科，到了微观就与物理、化学重叠了，因此可以说生物学只在一定的宏观层面存在。这是学科属性决定的。

社会科学是在生物学之上的学科，因为社会是由生物构成的。生物的属性是社会属性的基础。但是我们又不能用还原论研究社会科学，否则就没有社会科学存在的必要了。社会科学也分宏观和微观（如微观经济学、宏观经济学），越是宏观的，抽象程度越高，越复杂，研究方法越趋于统计，预测精确性越差，反之亦然。

思维科学是一门很难进入的研究学科，因为思维科学研究的是思维机制，而我们缺乏针对人脑的研究方法和工具。1、最初人们会忽视将思维作为一种研究对象。因为人们看到的是客观世界，而思维是无形的，是我们工具，一般而言，人们不会没事将工具拆来拆去。但是随着对世界认识的深入，人们开始反思自我，反思这个盲点之后的世界。2、初步探索阶段。人们开始认为思维器官是在心脏，因为心脏与思维活动同步性最明显，当我们情绪紧张的时候，心跳速度加快。人们也缺乏研究思维的有效方法，于是内省、行为主义、解剖学、颅相学、精神分析等各种可能分方法都从各种邻近学科中引进过来，走了很多弯路。这些引进不是没有一点成效，但是效果不完美。3、认知科学。就是从信息处理的角度研究，这可以说是思维科学的入门。因为人脑的基础过程是信息处理过程，但是这不是思维科学的全部。4、多层次思维科学。就是将思维科学研究对象按层次划分，从而对思维科学划分了多个不同类别的研究对象，分别采用不同的研究方法。分别为：信息处理、意识机制、心理角度、人格角度、社会角度。这样分类是因为它们之间有承接关系和各自的研究方法。对于不同研究对象采取针对性研究方法是正确的科学手段，而依据方法分科则是正确的分科做法。思维科学的正确分科是思维科学真正成为一个科学体系的标志。

智能科学与思维科学的关系。智能科学侧重于研究智能的本质、智能的形成机制、智能的实现方法、智能系统的具体应用等，是更贴近实践的学科。思维是具有智能的，否则就失去了思维的价值，但是同为思维，却有智能的高低之分，因此从智能的角度进行研究，可以创造出更有价值的思维系统。智能科学可作为思维科学的一个分支。