雍正八年，刑部等会商结果是：

    吕留良撮尸枭首，财产入官。子吕葆中也是撮尸枭首。子吕毅中斩立决。其他子孙、兄弟、伯叔兄弟及儿子，还有这些人的妻妾、姊妹及儿子的妻妾都应按律完结。

    各省府州县把已经印刷和抄录的吕留良文集、日记、诗集等一律焚毁。

    雍正谕旨，称“本来吕留良的罪过不可宽恕，但是天下读书人很多，可能还有人认为不至于处以极刑。为了慎重起见，使这件事办的合乎人心，还有将来不至于有人说没见过吕的诗文，怀疑是否有问题，应当发文给各省学政，征询各地生员的意见，是否同意刑部等会商结果，并且要签名具状”。

    征询结果可想而知。雍正十年批准并执行以上判决。雍正十二年，吕的家族后人60多口到达宁古塔为奴。