元气自然论是王充思想体系的核心

王充在《论衡》中说，元气是世界的基源。元气论是对于万事万物（包括人的形成及其变化）的思考，自然社会现象是客观的，具有必然性和自发性。

王充认为，天地之间存在“气”，万事万物皆由“气”构成，“气”的运动导致了万事万物的生成与变化。天、地和气都是无意识的存在，天地通过气对万物（包括人）产生影响。气的本质是特定的、不变的，而气的状态又是不断运动变化的。气又称为元气（元，开始之意），元气被认为是天地产生的原始的气。王充认为气是无形的、流动的、看不见的、物质性的、基础性的、永恒的和自然无为的。天地通过元气衍生出万物，万物在气的不断运动中产生。人的产生也是天地气运动的结果，就像是夫妇之间的阴阳交合之气产生孩子一样。然而万物皆不同，禀受元气的厚薄粗精不同，因而其形体和属性也存在有巨大的差异。人有知识和智慧，是因为人禀受的元气比较厚渥，人是由最精细的带有精神属性的精气所构成。王充强调：一切事物的产生都是一种自然的过程，一切事物的变化都是自发的、客观的、必然的，反对董仲舒宣扬的天有意识地创造人类、创造万物的主张，反对天有意识地降下祥瑞与灾异。王充将气视为万物发展变化的原因和动力，认为自然中的各种现象是气自然作用的结果。事物禀气的厚薄决定着事物的好坏，人禀气的厚薄决定了人的死生富贵贫贱。

王充用唯物主义的观点和对自然、社会现象认识中总结的经验来说明“天”是自然的是独立于人的主观意识之外客观存在的，因此不能用人的主观意向去把“天”拟人化。