有些基因的蛋白质产物的氨基酸序列与基因的初级转录产物序列并不完全对应，mRNA上的一些序列在转录后发生了改变，称为RNA编辑（RNA editing）。

例如人类基因组中只有一个载脂蛋白B（Apo B）基因，转录后发生RNA编辑，编码产生的Apo B蛋白却有2种，一种是Apo B100，由4536个氨基酸残基组成，在肝细胞合成；另一种是Apo B48，含2152个氨基酸残基，由小肠粘膜细胞合成。这两种Apo B都是APOB基因产生的mRNA编码的，然而小肠粘膜细胞存在一种胞嘧啶核苷脱氨酶，能将APOB基因转录生成的mRNA的第2153位氨基酸的密码子CAA（编码Gln）中的C转变为U，使其变成终止密码子UAA，因此Apo B48的mRNA翻译在第2153个密码子处终止。

又如，脑细胞谷氨酸受体（GluR）是一种重要的离子通道。编码GluR的mRNA在转录后还可发生脱氨基使A转变为G，导致一个关键位点上的谷氨酰胺密码子CAG变为CGG（精氨酸），含精氨酸的GluR不能使Ca²⁺通过。这样，不同功能的脑细胞就可以选择性地产生不同的受体。HGP曾估计人类基因总数在五万到十万甚至更多，但是2001年计划完成后认为之后约2万~2.5万个基因。RNA编辑作用说明，基因的编码序列经过转录后加工，是可有多用途分化的，因此也称为分化加工（differential  RNA processing）。