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真核生物和原核生物的终止子

(2014-07-15 13:12:02)
标签:

股票

分类: Bioinformatics

 位于基因编码区下游,能够终止RNA转录合成的特殊DNA序列称为终止子(terminator)。原核生物的终止子均具有回文结构,可分为依赖ρ因子和不依赖ρ因子的终止子两种类型。真核生物的终止子则与polyA尾的添加相偶联。

原核生物的终止子(Terminators in Prokaryote

   终止子有强、弱之分,强终止子含有反向重复顺序,可形成茎环结构,其后面为polyT结构,这样的终止子无需终止蛋白参与即可以使转录终止。
   而弱终止子尽管也有反向重复序列,但无polyT结构,需要有终止蛋白参与才能使转录终止。
   典型转录终止子的特征:茎环结构,富含GC;含4个以上的U

        依赖ρ因子的终止子:由终止因子(ρ因子)识别特异的终止信号,并促使RNA的释放(图)。 

 

http://s8/middle/4b07ffbcnc4df36457427&690

图 由ρ因子介导的转录终止
Fig
 Transcriptional Termination Mediated by ρ Factor

        不依赖ρ因子的终止子:模板DNA链在接近转录终止点处存在相连的富含GC的反转重复序列和AT的区域,使RNA转录产物形成寡聚U及发夹形的二级结构,引起RNA聚合酶变构及移动停止,导致RNA转录的终止(图)。 

http://s6/middle/4b07ffbcnc4df39d32ea5&690

图 由RNA茎环结构介导的转录终止
Fig
 Transcriptional Termination Mediated by a Stem-loop Structure of RNA

两类终止子的比较:

两类终止子有共同的序列特征转录终止点前有一段回文序列。回文序列的两个重复部分(每个720bp)由几个不重复的bp节段隔开。回文序列的对称轴一般距转录终止1624bp

两类终止子的不同点是:不依赖ρ因子的终止子的回文序列中富含GC碱基对,在回文序列的下游方向又常有68AT碱基对(模板链上为A、在mRNA上为U);而依赖ρ因子终止子中回文序列的GC对含量较少。在回文序列下游方向的序列没有固定特征,其AT对含量比前一种终止子低。

真核生物的终止子(Terminator in Eukaryote

        真核生物终止子,在mRNA前体的近3'-端处转录产生一组共同序列,即AAUAAAGU-rich序列,为转录终止的识别位点和poly(A)修饰识别位点。在转录越过修饰点后,RNA链在修饰点处被水解切断,转录终止,随即进行加尾修饰(图)。  

http://s14/middle/4b07ffbcnc4df3b0a399d&690

图 真核生物的转录终止
Fig
 Transcriptional Termination in Eukaryote

转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_4b07ffbc010172rb.html

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