明万历间，清嘉庆六年（1801年），民国12年（1923年）三次重修，寺中屹立着三块石碑，记录了历代对天竺寺进行重修有关事宜。

1958年公社化时期“破四旧”，古刹被废。改革开放以后，为保护历史文物，1986年以后又二次大规模重修扩建，古刹重放光彩。

天下名山僧占多。天竺寺原本就是名闻遐迩的佛教小丛林，宋时叫天竺庵，为严谨的女众丛要。

元代，元妙法师从嵩山少林寺隐居天竺山而住持禅寺，之后改天竺庵为天竺寺。

古刹几经兴废，明、清时期，香火最盛，天竺寺以山青水秀清泉幽竹、风光旖丽、环境清幽、古往今来吸引众多文人墨家到此观光揽胜，留下不少名篇佳句，为之吟咏不绝。

明代闽中“十才子”之首林鸿慕名造访古刹，《题海上天竺寺》诗曰。