加载中…使用makeblastdb建立blast的index
(2016-11-06 23:12:30)| 分类： 生物信息学 |
1:在使用blast+建立blastdb的index的时候，建议添加参数：-parse_seqids
makeblastdb -in input.fa -dbtype prot -parse_seqids
或者
makeblastdb -in input.fa -dbtype nucl -parse_seqids
默认你的数据库序列ID是类似（gnl|MYDB|2 ）形式，如果不是程序会自动添加，所以就不能识别你的ID了。
2：备注我使用的blast+是2.2.30+
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