加载中…
个人资料
  • 博客等级:
  • 博客积分:
  • 博客访问:
  • 关注人气:
  • 获赠金笔:0支
  • 赠出金笔:0支
  • 荣誉徽章:
正文 字体大小:

siRNA产品使用说明

(2011-06-15 15:38:23)
标签:

使用方法

细胞实验

sirna

细胞培养

杂谈

分类: siRNA

产品简介

常规化学合成siRNA21-25nt的双链小分子RNA,即用型。

运输与保存

产品一般以冻干粉的形式常温运输。收到产品后,请于 -20℃~-80℃保存,冻干粉可以稳定保存一年以上。使用前请用灭菌的RNase-free H2O或者灭菌的ddH2O,配制成20μM溶液,建议分装保存,避免反复冻融 (尽量不要超过5)。如需要长期保存,产品请以冻干粉形式保存。

1  20μM存储液的配置

siRNA(nmol)

0.25

0.5

1

2

5

20

溶解体积(μl)

12.5

25

50

100

250

1000

注:如需进行筛选试验,可选择以96孔板密封的冻干粉或液体形式提供的siR-RiboTM siRNA Library

使用方法

产品已经经过纯化、退火等处理,只要用灭菌的ddH2ORNase-free water溶解即可直接转染细胞或供动物实验使用。为避免外界因素(包括酶,极端pH或者温度条件等)导致产品降解,所有操作请严格遵循RNA操作规则。实验过程中,产品最好于冰上放置,使用完毕后请于-20℃~-80℃小心保存。

 

细胞实验

为了降低因细胞密度、试剂用量,转染效率等因素导致的孔间差异,保证实验的可靠性和可重复性,一般建议:

a. 每次转染实验时,每个转染样品至少设置3个复孔;

b. 接种细胞时,尽量接种相同或相近数量的细胞于细胞培养板,使细胞在各孔的表面均匀分布。

1. 转染浓度

最佳转染效率一般设置时间曲线和浓度梯度进行测试,推荐初始的转染时间为6h,转染后检测的时间为24-72h,初始转染浓度是50nM,可视具体情况优化,建议优化转染浓度梯度为100nM50nM30nM20nM10nM (2)

2. 转染步骤:以lipofectamineTM 2000(简称lipo2000) 转染siRNA24孔细胞培养板为例,其他规格容器转染请参考表2

1)  转染前一天,接种适当数量的细胞至细胞培养板中,每孔中加入不含抗生素的培养基,使转染时的细胞密度能够达到30~50%汇合度 (不同细胞生长速度不一样,因此,接种细胞的数量需要根据细胞培养的经验)。注意:转染时,细胞密度是影响转染效率的关键因素之一,细胞生长过密可能会削弱细胞活力,导致细胞转染效率的降低。

2)  对于每个转染样品,按如下步骤准备siRNA-lipo2000混合液:

a.  稀释siRNA:用50μl不含血清培养基Opti-MEM®Ⅰ(v2)稀释25pmol siRNA (加入细胞中的RNA终浓度50nM),轻轻混匀,室温孵育5min

b.  稀释lipo2000:用50μl不含血清培养基Opti-MEM®Ⅰ(v2)稀释1μl lipo2000,轻轻混匀并室温孵育5 min

c.  ab轻轻混匀,室温孵育20min(溶液可能会有浑浊,但不会影响转染)。

注:稀释好的lipo2000长时间放置可能导致转染试剂活性的降低,应尽量在25min之内与稀释好的siRNA混合。混合试剂请勿剧烈吹打或振荡,手指轻弹管壁即可,过度用力可能会破坏试剂中脂质体结构及siRNA-lipo2000混合物的形成。

3)  siRNA-lipo2000混合液加入含有细胞以及培养液(v1)的培养板各孔中,轻轻混匀;

4)  将培养板置于37 ℃CO2培养箱中培养24-96h (检测时间与研究实验目的有关。培养4~6h后,可以将孔里含有siRNA-lipo2000混合液的培养基移去,更换新鲜的生长培养基,也可以进行其他必要的特殊处理(如加药处理)

2  使用lipo2000(invitrogen)转染siRNA产品用量参考

V1:完全或不完全培养基;v2: Opti-MEM® I (无血清、无抗生素,转染专用)

 

每孔中总体积(v1+v2+v2)

终浓度

siRNA

lipo2000

DNA共转染

96-well

100μl (50μl+25μl+25μl)

100nM

0.5μl

0.25μl

10-100ng

 

100μl (50μl+25μl+25μl)

50nM

0.25μl

0.25μl

10-100ng

 

100μl (50μl+25μl+25μl)

30nM

0.15μl

0.25μl

10-100ng

 

100μl (50μl+25μl+25μl)

20nM

0.1μl

0.25μl

10-100ng

 

100μl (50μl+25μl+25μl)

10nM

0.05μl

0.25μl

10-100ng

24-well

500μl (400μl+50μl+50μl)

100nM

2.5μl

1μl

100-200ng

*

500μl (400μl+50μl+50μl)

50nM

1.25μl

1μl

100-200ng

 

500μl (400μl+50μl+50μl)

30nM

0.75μl

1μl

100-200ng

 

500μl (400μl+50μl+50μl)

20nM

0.5μl

1μl

100-200ng

 

500μl (400μl+50μl+50μl)

10nM

0.25μl

1μl

100-200ng

12-well

1mL (800μl+100μl+100μl)

100nM

5μl

2μl

200-400ng

 

1mL (800μl+100μl+100μl)

50nM

2.5μl

2μl

200-400ng

 

1mL (800μl+100μl+100μl)

30nM

1.5μl

2μl

200-400ng

 

1mL (800μl+100μl+100μl)

20nM

1μl

2μl

200-400ng

 

1mL (800μl+100μl+100μl)

10nM

0.5μl

2μl

200-400ng

6-well

2mL (1500μl+250μl+250μl)

100nM

10μl

5μl

500-1000ng

 

2mL (1500μl+250μl+250μl)

50nM

5μl

5μl

500-1000ng

 

2mL (1500μl+250μl+250μl)

30nM

3μl

5μl

500-1000ng

 

2mL (1500μl+250μl+250μl)

20nM

2μl

5μl

500-1000ng

 

2mL (1500μl+250μl+250μl)

10nM

1μl

5μl

500-1000ng

*:实验参考用量示例;当实验涉及DNA共转时参考

3. 效果检测

转染完成后24~72小时均可进行siRNA沉默效果检测,最佳检测时间与使用的细胞类型有关,可通过分时检测来优化。

1) mRNA 水平的检测:mRNA是检测siRNA沉默效率的最好指标,一般来说siRNA转染后24~72h即可以检测到靶mRNA水平明显降低,检测方法一般采用Real-time PCR定量检测(引物设计质量很重要)

2) 蛋白水平的检测:蛋白水平的检测通常需要借助抗体或报告基因系统检测。检测手段有Western-blot、免疫组化等。检测时间受细胞内蛋白质表达量、蛋白质本身的半衰期等因素的影响,一般为48~96h,甚至更长时间之后多点采样。

3)功能筛选:应用EdU细胞增殖、EdUTP细胞凋亡等检测试剂盒进行siRNA对细胞功能的直接筛选。


动物实验

动物模型:根据实验需要选择合适的动物模型,以小鼠最为常用,用量较小(3)

修饰方式:由于动物实验对siRNA稳定性的要求较高,尽管未修饰的siRNA也可以进行动物实验,但是以CholOMePS修饰的siRNA最为常用,效果较好。

给药方式:静脉给药:适合心、肝、肾、肺、原位瘤等血流丰富的组织器官;呼吸道给药:适合呼吸系统;腹腔给药:适合腹腔和盆腔内脏器,胰、脾、肾、卵巢等;颅内给药:脑部,适合中枢神研究;局部给药:眼、皮肤、子宫腔、阴道、移植瘤等。

效果检测 :锐博生物提供标记有Cy3Cy5siRNA可以进行实时观测药物分布,其他效果检测应根据实验目的进行设置。

3 动物siRNA实验使用方法参考 *: 更多信息请点击www.siRNA.cn/siRNA/invivo.aspx

 

Reference

Animals

Tissue

Gene

Modification

Doses

Dosing Frequency

 

Mice

Tumor

 

-Chol,-OMe,-PS

1 nmol

Twice/week4 weeks

Höbel S ,et al. J Gene Med 2010

Mice

VEGF

-F,-OMe,-PS

1.3 μg

Day 0

M. DiFiglia, et al. PNAS. 2007

Mice

Brain

Htt

-Chol,-OMe,-PS

1 nmol

Day 0

Wang H,et al.J Biol Chem. 2008

Mice

SOD1

-F,-HS

4 µg

Continuous 28 days

Lewis J, et al. Mol Neurodegener. 2008

Mice

SNCA

-OMe,-PS

180 nmol

Continuous 15 days

Xiong SQ, et al. Ophthalmologica. 2009

Mice

Eye

EPO

None

5 µg

Day 0

Kleinman MEet al. Nature. 2008

Mice

VEGF

-Chol,-OMe

1 μg

Day 0

LI Xi, et al. Chinese Journal of Pathophysiology.2008

Rat

Liver

Fas

None

40 nmol

Day 0

Soutschek J,et al. Nature. 2004

Mice

apoB

-Chol,-OMe,-PS

1.25 mg

Continuous 3 days

Zimmermann TS, et al. Nature. 2006

Monkey

apoB

-OMe,-PS

~15mg

Day 0

Tompkins SM,et al. PNAS. 2004

Mice

Breath

Influenza

None

20 µg

Day 0

Rosas-T,et al. Am J Respir Cell Mol Biol. 2009

Mice

XCL1

None

10-15 µg

Day 0

Yuan H,et al. Am J Physiol Renal Physiol. 2008

Mice

Kidney

Alox15

-Chol,-OMe,-PS

400 µg

Continuous 7 weeks

Gonzalez-Gonzalez E,et al. Gene Ther. 2009

Mice

Skin

CBL

None

60 µg

Continuous 12 days

Yichao Wu, et al. Cell Host Microbe. 2009

Mice

HSV-2

-Chol, -PS

2 nmol

Day 0

 

0

阅读 收藏 喜欢 打印举报/Report
  

新浪BLOG意见反馈留言板 欢迎批评指正

新浪简介 | About Sina | 广告服务 | 联系我们 | 招聘信息 | 网站律师 | SINA English | 产品答疑

新浪公司 版权所有