迄今为止，历史学家和植物学家也没有具体的证据，能够确切地证明咖啡的起源。历史上有许多关于咖啡起源的传说和故事。比较流行的传说有两种。

（1）牧羊人卡尔迪的故事。大约公元500多年，传说在非洲埃塞俄比亚卡法地区有一个叫卡尔迪的牧羊人，有一天发现自己饲养的羊群忽然在那儿不停的蹦蹦跳跳，他觉得非常不可思议，仔细观察，发现羊群吃了一种红色的果实。于是他便拿着这种果实分给修道院的僧侣们吃，所有的人吃完后都觉得神清气爽；据说此后这种果实被用来做提神药，而且颇受医生们的好评。

（2）阿拉伯半岛上北也门摩卡的守护圣徒雪克欧玛的故事。1258年，因犯罪（犯什么罪？他暗恋国王的女儿！）而被族人驱逐出境的酋长雪克欧玛，流浪到离故乡摩卡很远的瓦萨巴（位于阿拉伯）时，已经饥饿疲倦得再也走不动了，当他坐在一丛结有红色果实的灌木边休息时，发现有一只鸟飞来停在枝头上，以一种极为悦耳的声音啼叫着。他仔细一看，发现那只鸟是在啄食枝头上的果实后，才发出欢快美妙的啼声，所以他便将那红色果实全采下放入锅中加水去熬煮。之后竟开始散发出浓郁的香味，喝下去不但觉得好喝，而且还觉得疲惫的身心也为之一振。于是他便采下许多这种神奇果实，遇有病人便拿给他们熬成汤来喝，最后由于他四处行善，故乡的人便原谅了他的罪行，让他回到摩卡，并推崇他为圣者。

（3）除了上两种较为人津津乐道的传说，咖啡何时成为人们生活中的饮料，真实时间已不可考。根据历史学家和植物学家共同考证，公元525年，埃塞俄比亚的军队曾经打过红海，打到今天阿拉伯也门的国土上，并且统治也门半个世纪之久。很有可能是当时埃塞俄比亚的军队士兵把这种能够提神的果实做为随军的食品带到了阿拉伯的土地上。阿拉伯国家还流行一种传说，说是有一群大鸟，从埃塞俄比亚飞越红海，衔来了咖啡的种子，在阿拉伯的土地上生根。

还有根据阿拉伯古文献上记载，公元十一世纪，伊斯兰教戒律禁止教徒们喝酒，当时阿拉伯地区盛行将晒干的咖啡豆煎煮成汤汁，当成胃药使用。教徒们发现这种咖啡汁液有提神的效果，就用它作为替代酒类的振奋性饮料，并且以伊斯兰教圣地麦加为中心，将这种饮料由信徒往来流传开，由阿拉伯传到埃及，再传到敘利亚、伊朗、土耳其等地。到了十三世纪以后，阿拉伯人已懂得将生咖啡豆晒干，加以烘焙，用杵臼捣碎后，再用水熬煮，因而得到品质较纯的咖啡。这种常绿灌木果实的果仁（咖啡豆）才被人们有意识地采摘，经过适当的烘焙方法烘焙，再用各种不同的烹煮器具制作出来，就成了我们今天所说的“咖啡”。在希腊语中咖啡被叫做Kaweh，意思是“力量与热情”。

（4）目前，历史学家和植物学家比较一致的认为，应该早在公元500年前，咖啡这种植物就已经在非洲埃塞俄比亚高原上自由自在地生长着。一种植物的发现和使用，绝非一人一时能够做到的。是非洲当地土著人经过许多年的观察、慢慢试着吃这种果实，首先发现它没有毒，其后又发现了它解除疲劳、帮助消化、使人精神振奋愉悦等等功效，后来发展到咀嚼研磨后的咖啡豆来治疗胃病，在当时缺医少药的非洲，这就是治病的良药呀！为什么历史上要把发现咖啡的功劳赋予两个具体的人呢？这就是英雄史观，总是把一些伟大的事归功于某个具体的人，认为历史就是伟人创造的。所以演译出了这样一些美丽的传说。不管怎样，无数的非洲土著人和阿拉伯人，经过成年累月的亲身试验，发现了咖啡这种植物的可食用性，以及咖啡的初步功效。关于咖啡的起源蕴涵了无数浪漫、离奇的故事，其中真假或许并不重要，但可以肯定的是，咖啡是勤劳的非洲人民发现的，是亚洲的阿拉伯人民把它发扬光大的。有人说，咖啡是除了火以外上帝给人类的第二个礼物，我们说，咖啡是第三世界的人民给全世界带来的欢乐。