由于不明确先天性心脏病的成因，因此缺乏有效的预防方法。但做好以下方面能减少先天性心脏病的发生。

对于怀孕的准妈妈老说，做好以下的预防措施很重要。

首先，某些子宫内的病毒感染所致先天畸形多伴先天性心脏病，如风疹(如何治疗风疹)病毒综合征。因此妊娠期尤其妊娠早期预防病毒感染是重要措施。妊娠期服用某些药物可导致心脏畸形。

第二，糖尿病(如何治疗糖尿病)、癫痫(如何治疗癫痫)等病的患者应在医生的指导下决定结婚、怀孕时间。女同志应在妊娠前适当增加营养，加强体育锻炼，以增强抗病能力。

第三，长期接触放射线或接受放射线治疗者要在脱离放射线半年后再妊娠。

第四，经常接触各种农药、化学药物的妇女应加强防护措施，不用或少用四环素、磺胺、苯丙胺、孕酮类、雌激素类、抗惊厥(如何治疗惊厥)药和激素类药物，不用含激素的化妆品。

第五，母亲酗酒，婴儿可患酒精中毒综合征，常伴发室间隔缺损、动脉导管未闭(如何治疗动脉导管未闭)、房间隔缺损、法洛氏四联症等，因此夫妻双方都应戒烟戒酒。

此外，如果父母曾患先天性心脏病，或曾有患先天性心脏病的子女，再妊娠时提倡做胎儿超声心动图，以利于早期检出患先天性心脏病的胎儿，若为复杂或难治性先天性心脏病可考虑早期引产。