BC₁（回交一代）也是一种常用的作图群体。BC₁群体中每一分离的基因座只有两种基因型，它直接反映了F₁代配子的分离比例，因而BC₁群体的作图效率最高，这是它优于F₂群体的地方。BC₁群体还有一个用途，就是可以用来检验雌、雄配子在基因间的重组率上是否存在差异。其方法是比较正、反回交群体中基因的重组率是否不同。例如正回交群体为（A×B）×A，反回交群体为A×（A×B），则前者反映的是雌配子中的重组率，后者反映的是雄配子中的重组率。

虽然BC₁群体是一种很好的作图群体，但它也与F₂群体一样，存在不能长期保存的问题。可以用F₂中使用的类似方法来延长BC₁群体的使用时间。另外，对于一些人工杂交比较困难的植物，BC₁群体也不太合适，因为一是难以建立较大的BC₁群体，二是容易出现假杂种，造成作图的误差。

顺便一提，对于一些自交不亲和的材料，可以使用三交群体，即（A×B）×C。由于存在自交不亲和性，这样的三交群体中不存在假杂种现象。