生物医学影像分析软件--ImageJ计算细胞数(转载)
					
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相信许多朋友也许也在找一种影像软体,可以自动帮你计算细胞数,比方说常常用使用4'-6-Diamidino-2-phenylindole
(DAPI),或是用其它的抗体在做免疫染色(Immunohistochemistry
Staining),要如何把影像的资讯数量化呢?最常用的就是计算染色的细胞数。那有没有软体可以自动帮你算细胞数呢?大概在90年中就有人在做这种影像分析,在2000年左右也有不少文章介绍各实验室自己开发的软体,也免费的提供下载。最近由猪排饭同学介绍一套软体ImageJ,是由National
Institutes of Health
(NIH)所开发免费且跨平台(windows、Mac、Linux都可用)的影像分析软体,试用一下觉得相当好用。请参考以下之教学: 
     
step 1. 下载安装ImageJ软体:
http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html 或ImageJ下载
http://ggene.cn/html/protocol/ruanjianjiaocheng/2009/0421/284.html  
http://ggene.cn/html/protocol/ruanjianjiaocheng/2009/0421/284.html
请依据不同作业系统选择适合的版本 
step 2.
http://ggene.cn/uploads/allimg/090421/2222491U2-0.jpg
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 
step 3.
设定分析影像的阈值(Image->Adjust->Threshold,或快捷键Ctr+Shift+T)
http://ggene.cn/uploads/allimg/090421/22224a3I-1.jpg
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
step 4.调整阈值再按set决定。
http://ggene.cn/uploads/allimg/090421/22224a351-2.jpg
  
  
  
  
  
  
  
  
  
step 5.
选择analyze
particle(Analyze->Analyze particle)
并且记得要选择summarize,才会有分析的结果。
并且记得要选择summarize,才会有分析的结果。
http://ggene.cn/uploads/allimg/090421/2222491916-3.jpg
  
  
  
  
  
  
  
  
http://ggene.cn/uploads/allimg/090421/2222492113-4.jpg
  
step 6.
分析结果,可以看到原图像的视窗会出现电脑判读的数据,summary会显示个数及分析影像的区域大小
http://ggene.cn/uploads/allimg/090421/2222492113-4.jpg

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