一是二重性。孔子的思想是复杂的，从政治观念上看，具有明显的二重性。孔子作为人类历史上伟大的思想家，在一定程度上能够突破时代和阶级的局限性，对一些问题（例如同情人民疾苦）比一般人看得更远些、更高些，其思想带有明显的人民性、民主性。但孔子是封建社会的产物，是封建统治阶级的忠实代言人，其思想还带有浓厚的封建性、保守性。从哲学角度看，孔子思想也有二重性，既有唯物主义因素，也有唯心主义因素。其思想包容广泛、错综复杂，有时又呈现出一种自相矛盾的现象（二重性）。简单地把他说成是唯物主义者或唯心主义者，都是不恰当的。

二是略于“天道”，详于“人道”。由于时代和科技的限制，孔子谈“天道”，即谈自然现象（自然科学）问题的时候很少，正如子贡所说：“夫子之言性与天道，不可得而闻也。”虽然有时也谈，但一谈就谈成宿命论的“天命”。因此，他对哲学上的根本问题——即物质与精神孰先、客观世界能否被人正确认识，基本上没有或很少接触到，因而也就不可能提出这样那样的系统回答和论证。而正由于他略于“天道”，无论对当时还是后世都起了轻视自然科学的消极影响。但另一方面，孔子非常重视社会和人生实际，重视研究社会现象和伦理观念，对社会的、伦理的问题谈得很多。他精通古代文献典籍，博闻强记，深刻了解当时社会的、政治的、经济的现象和民间习俗。在这方面，他确实称得上是一位承上启下、博古通今的伟大学者和思想家。

三是仁为核心、礼为形式的仁礼观。在孔子的思想体系中，仁、礼是最重要的两个概念。仁是孔子思想体系的核心和哲学概括，它是人的本质，是修己、爱人的内在自觉性。仁是一种人道主义思想，强调人们之间的仁爱、谅解、关怀、宽忍，也强调人民物质生活的安定和提高等等。礼是宗法等级社会的制度和规范，它强调的是尊卑长幼之序，是具有不同名分的人之间的区别与对立。礼还是人们的行为准则，体现了社会对人的外在约束。仁是礼的思想基础，礼是仁的外在表现形式，二者相互制约、相互辅佐，从而达到一种有等级（礼）但不过分对立（仁），有仁爱和关怀（仁）但不无区别（礼），亦即等级与仁爱对立与和谐的统一，和大家生活安定富裕的理想状态，这便是理想的小康社会。