马姓的来源主要有以下几种：

　　由“赵氏”而来。战国时期赵国大将赵奢，以善于用兵著称。因战功卓著，赵惠文王将其封于马服，称“马服君”。其子孙遂以“马服”为姓，后改单姓“马”。汉武帝时期，其后代迁至右扶风茂陵（今陕西兴平东北）。

　　由他姓改姓。如东汉大司徒马宫，本姓马矢，后改姓马；五代司马球，其后代改为姓马……

　　司马迁族人，改姓司或姓马。

　　由他族改姓。据《金史·列传第六十二·忠义四》所载，马庆祥，字瑞宁，本名习礼吉思。先世自西域入居临洮狄道，以马为氏，后徙家净州天山（今内蒙古四子王旗）。即拜凤翔府路兵马都总管判官。另据《元史·列传第三十三》所载，马祖常，字伯庸，世为雍古部，居净州天山。有锡里吉思者，于祖常为高祖，金季为凤翔兵马判官，以节死赠恒州刺史，子孙因其官，以马为氏。曾祖月合乃，从世祖征宋，留汴，掌馈饷，累官礼部尚书。

　　伊斯兰教创始人穆罕默德曾被译为“马哈麻”“摩珂末”“谟罕德”等。后信奉伊斯兰教的一些少数民族便以“马”为姓（其他还有以“哈”“麻”等为姓的），这也是回族中马姓最多的原因之一。

　　其他如金朝时女真人汪古氏，元朝时蒙古合鲁氏，清满洲八旗费莫氏、马佳氏，均有改姓为马者。