大圆寺位于西安市鄠邑终南山紫阁峪口，始建于汉明帝年间，为关中地区历史最为悠久的古老寺院之一。公元71年，汉明帝夜梦张良，授意建寺，名鱼盘寺，至今已近2000年。实据《户县县志》记载，该寺建于明嘉靖三十四年(1555)、因寺僧大园得名。

六朝时期，此地置大寺，僧众众多。有弘觉主寺，曾为姚苌(后秦开国皇帝)讲《法华经》，后秦弘始三年，鸠摩罗什入关，先在逍遥园译经，后入大寺，这里曾是国家译经场的一角。西魏时期，大寺一分为四，大圆寺即为大乘寺。寺院原供奉三尊千斤佛像，一为释迦，一为弥陀，一为韦陀，均属六朝之物。

唐代，寺院曾为楚金大和尚的驻锡地，唐德宗临朝，追忆楚金为"大圆禅师"，大圆寺之名，即因此起。寺院现存二龙戏珠石雕碑额一方。据说，唐太宗拜谒草堂，来鱼盘寺住过。镌此石刻，文武百官朝拜时不得践越，是谓"三尺禁地"。

明代万历年间重修。清初、康熙四十二年先后两次增修。

民国时期，寺院存佛殿三间，二门楼两间，东西各有草房三间，四周有石垒的围墙，住僧二三人，供奉三尊佛像及一尊弥勒佛泥像，有耕地一百三十多亩。

建国后，尚存大殿3间、铜像5尊，土地划归当地群众，后有东北源海尼师和徒弟湛慧住寺，在乱石中垦荒种地，坚忍不拔，使宗教活动不辍。不幸的是，三尊六朝遗留的铜佛及石碑毁于六十年代。

后续觉入寺，帮助师祖修复了三间佛殿，改建了东西厢房，增建了东西寮房，使寺院恢复了生机。