后因天灾人祸，寺庙毁损殆尽。如果说历史上的云翔寺曾经蜚声江南，那么复建后的云翔寺正以其崭新的面貌饮誉沪上和海外。重建后的云翔寺又名留云寺，寺名源于上海南市区的留云寺。的寺庙占地15亩，规模宏大，布局合理、严谨，共分三进院落，于中轴线上布置主要殿堂：山门、观音殿、大雄宝殿和藏经楼，左右对称布置伽蓝殿、大势至殿、钟楼、鼓楼、文殊殿、普贤殿、上客堂、僧寮等，并有迥廊围绕。此外，在地下建有功德堂、万佛堂。

山门

观音殿

观音殿北侧---慈航普渡

观音殿一侧是钟楼

观音殿另一侧是鼓楼

左右对称布置伽蓝殿、大势至殿、

三进是大雄宝殿

大雄宝殿一侧是文殊宝殿

大雄宝殿另一侧是普贤宝殿

“扬佛之光”中国佛教协会为云翔寺重建落成，全寺佛像开光志庆匾，悬挂在僧侣习诵佛经的佛堂。寺庙仿唐代建筑风格，气势恢宏，建筑色调古朴庄重，尽显东方佛土庄严。  

 

凇沪抗日战争爆发，十九路军总指挥部设在南翔寺，寺庙屡遭日机轰炸。到解放前夕，云翔寺只剩一个小和尚看守残存的一座地藏殿了。

原上海南市区内有座名寺“留云寺”，创建于公元1876年，抗战时期毁于战火。 1998年，经政府批准，在南翔恢复已经毁损了二百多年的云翔寺，并由中国佛教协会会长赵朴初居士为“云翔寺”题匾额。上海南市区原有座创建于清光绪二年（1876）的留云寺，抗战时期毁于战火。2001年，留云寺第六代传人、台湾悟明长老倡议重建留云寺，上海佛教界集合众议，决定由慧禅法师受命在南翔古镇原址西移60米重建留云禅寺，使云翔寺与留云寺合而为一，续接香火。历时三年又五月，仿唐式建筑留云禅寺于2004年建成，总占地面积一公顷，寺庙面积和建筑规模在上海寺庙中堪称第一。