美岱召的总体平面布局为不规则的正方形，类似一座堡寨式的建筑，总面积约4万平方米。建筑群四周用大块河卵石垒砌成高约4米的城墙，城墙四角有突出的马面，正面为城门，上有垛门及一座3层歇山式的城楼。进入城门，迎面为大雄宝殿。殿墙上有彩色斑斓的壁画，除喇嘛教供奉的佛、菩萨、天王等像外，还有大量壁画是关于释迦牟尼的故事。西墙下层为人像壁画，正中端坐蒙古族装束的男女像，即阿拉坦汗及其夫人三娘子。大雄宝殿后是一座3层楼房式的琉璃殿，是阿拉坦汗接受朝拜的地方。琉璃殿的西侧有两座殿，八角形的叫做老君庙，另一座叫做万佛殿。万佛殿南面紧接着经堂的一座藏式建筑叫做乃春庙，是麦达力活佛居往的地方。经堂东北方有座重檐歇山式建筑，称太后庙。太后庙世传为供奉阿拉坦汗之妻三娘子骨灰的灵堂，现仍留有骨灰箱、腰刀、头饰、靴帽、盔甲等文物。美岱召是喇嘛教传入蒙古时一个重要的弘法中心，也曾是土默特蒙古部在丰州滩活动的政治中心。