吴哥寺是吴哥古迹中保存得最完好的的庙宇，又称为吴哥窟，原始的名字是“Vrah Vishnulok”，意为“毗湿奴的神殿”，以建筑宏伟与浮雕细致闻名于世，是世界上最大的庙宇。12世纪中叶，真腊国王苏利耶跋摩二世定都吴哥，因其信奉印度教毗湿奴，为国王加冕的婆罗门主祭司就为其设计了这座国庙，供奉毗湿奴的同时，也是埋葬苏利耶跋摩二世的坟墓。至十三世纪时期，因当时的真腊国王阇耶跋摩七世奉大乘佛教为国教，吴哥窟又成为大乘佛教寺，延续至今。
    吴哥寺坐东朝西，由一道明亮如镜的长方形护城河环绕，围出一个长方形的满是郁郁葱葱树木的绿洲，绿洲有一道寺庙围墙环绕，正中的建筑就是金字塔式的寺庙的最高层，矗立着五座宝塔，如骰子五点梅花，其中四个宝塔较小，排四隅，一个大宝塔巍然矗立正中，象征着世界的中心之山、众神居住的须弥山。宝塔与宝塔之间连接游廊，此外，须弥山金刚坛的每一层都有回廊环绕，乃是吴哥窟建筑的特色。

    吴哥寺的第一回廊的内侧墙壁为寺庙的外墙兼巨型画廊，排列壮丽精细的八幅巨型浮雕。每幅浮雕高二米余，长近百米，全长达七百余米，绕寺一周。浮雕描绘印度两篇著名梵文史诗《罗摩衍那》、《摩诃婆罗多》中的故事和一些吴哥王朝的历史。

    第二回廊间放置的“林迦”与“优尼”，在印度教中，“林迦”和“优尼”分别代表男性和女性生殖器，这是古代高棉民族崇拜生殖的产物。