康熙提升翰林院：康熙九年恢复的翰林院最初是顾问机构，也分有内阁职权，把原大学士控制的秘书、修书、文史职能都归翰林院负责，原内三院的秘书院、国史院实际归并到翰林院。内阁大学士主要从事政务不再监管修书、经筵日讲类的文化工作，翰林院早期是分担内阁繁重的工作。翰林院地位上升是在南书房建立后，从侍讲学士入值南书房起，翰林学士能直接长期与康熙在一起研究，翰林院与皇帝的关系更加密切。在平定三藩之乱期间，内阁中索额图党和明珠党形成，开始对立冲突，在索额图病免后，明珠独断专权，战后康熙要赦免耿精忠遭到明珠反对未果，加剧了康熙要进一步分内阁权的意图。“十六年，命侍讲学士张英等入直南书房。先是诏册词命多由院拟，至是始为西清专职”。西清是翰林院的代称，南书房逐渐成为诏命票拟的核心机构，入值南书房的翰林学士与内阁同样都具有了票拟职权，开始具有宰相职能。十六年张英、高士奇等入值南书房时还受制约，大学士传上谕“勿得干预外事”，在明珠独强失去制约后情况就发生变化了，康熙越来越重用南书房翰林。二十年康熙诏谕明珠让他派人掩埋暴露的骸骨等，就体现康熙已经更多自己直接给明珠下诏谕，不再让明珠去拟诏下达，让明珠当传话的。这以后反而重新让大学士担任监修史书的责任，减少了其政治决策职权。张英和陈廷敬入值弘德殿领南书房实际已经成为宰相，翰林院控制的南书房与内阁作用至此相同。弘德殿在乾清宫内侧是离大内最近的要地，比后来的军机处地点更接近皇帝，张英和陈廷敬每天都和康熙在这里办公学习。南书房翰林的影响力也越来越强，即使非日值弘德殿的徐乾学、高士奇等都受朝野尊敬，有时甚至明珠都要去高士奇那探听消息，他后来被罢相徐乾学、高士奇也发挥了重要作用。雍正时期设立军机处的目的与南书房基本相同，只是选择人员的对象从翰林院转向内阁和六部。在强化君权和行政效率防止权臣方面，南书房的作用显然比军机处要强，让没有多少官场基础和影响的翰林入值南书房，能最大限度体现君主意志，不受官僚体系影响。军机大臣都是大学士、尚书、侍郎等高官，皇帝任用起来自然不像用翰林学士随意、顺手，在制定决策时军机大臣比翰林学士更容易受官僚体系利害关系影响。康熙是在南书房让翰林学士执行宰相职权，进行宰相工作学习，再正式任命为宰相，是培养宰相。南书房所以被评价是“储材之要地也”，入值南书房的人尽管并非都是能当宰相的，但是就像后来军机处建立后，人们把它和内阁、翰林院重新并称三院那样，已经是宰相机构了。清朝的宰相包括：内阁大学士、入值南书房的翰林掌院学士、军机大臣，各时期职权轻重不同。