撒察别乞和铁木真尽管都是有资格继承汗位的，统领札剌亦儿十部、许慎等部的撒察别乞势力比起历经坎坷的铁木真强大很多，但是在蒙古各部推举汗位的时候他却支持铁木真为蒙古汗，并且还听从铁木真的请求前往攻打蔑尔乞惕支援克烈部，帮助札阿敢布，这记载在《元史》太祖本纪成吉思汗对汪罕的五项恩德中，当时蔑尔乞惕也是强大的部族，后来还一度吞并札木合部，撒察别乞能打败他们，参与帮助汪罕复位，估计也是一场非常艰苦的战役。

撒察别乞有如此力量为何自己不称汗令人疑惑。他和铁木真的恩怨和关系也有很多值得探讨，对他的评价不能简单认为是没落贵族，成吉思汗有四杰，博尔术是他幼年安达，赤老温是他的救命恩人，而木华黎、博尔忽都曾经是撒察别乞的部下，不能认为他与铁木真的兴起毫无关系。两人是如何反目成仇的，根据史料记载在铁木真宴会上，由于对撒察别乞的母亲礼仪上发生纠纷，把他母亲扣押，开始有了矛盾。而更深层的原因可能还要从十三翼战争开始说起，札木合与塔里忽台另外两个有力量当蒙古汗的，联合了十三部攻打铁木真，札木合指责众人擅自立铁木真，唯独没有指责撒察别乞，对两人进行了离间。在战争中造成铁木真失利的一个重要原因应该是撒察别乞支援汪罕过程中力量被削弱，而克烈部却坐视铁木真和撒察别乞被札木合联军攻打，军事失利使撒察别乞对铁木真不满，加上札木合的离间、母亲的受辱等等因素，造成了两人分道扬镳。

后来铁木真要和汪罕去支援金国攻打塔塔尔部，命令他也出兵，曾经支援过汪罕的撒察别乞完全拒绝前往，这是合理的，他对汪罕不支援他们对抗札木合不满，塔塔尔与金国矛盾，与铁木真有仇，但金国也是蒙古部的仇敌，尤其是撒察别乞和他统领的札剌亦儿与金国仇恨更深重，《史集》有金国屠杀札剌亦儿的记载，而作为他支持的蒙古汗铁木真接受金国封号，也是撒察别乞不能容忍的，他主动放弃蒙古汗这个崇高的名号的意义都丧失了，感觉受到屈辱而愤怒。加上铁木真要攻打乃蛮时，没派重要使臣来，撒察别乞因为以前的旧怨，杀了使臣中十人，赶走了另外的人，两人正式决裂。这是铁木真联盟内发生的最严重的内部冲突，是铁木真同撒察别乞两大集团的对抗。当时以赤老温父子为首的速勒都思、纳牙父子为首的八邻、阿鲁剌惕、忙忽惕、别速惕等部都归附了铁木真，通过对塔塔尔的战争也扩大了力量，铁木真已经有力量同撒察别乞对抗。

在战争结束后，铁木真招降了木华黎、博尔忽等札剌亦儿、许慎等部众。最终结果虽然是撒察别乞失败，但并不说明他是代表了反动腐朽力量。两大集团之间对抗的具体过程，史料没有详细记载，但是力量对比明显是撒察别乞处于不利的地位，铁木真与弘吉剌是姻亲，与克烈部是同盟，刚刚和金国联合，又部分吞并了塔塔尔，从这些外部因素看，撒察别乞几乎没有外援，这也可以表明他过去没有背叛铁木真的企图，没有勾结札木合、塔里忽台等铁木真的敌人，他失败后也没有去投靠他们。从两人的矛盾也可以看出，当年琐尔汗分析铁木真最终能统一蒙古部是正确的，撒察别乞在谋略上与铁木真还是有差距，两人固然都有要统一蒙古的愿望，可是在具体战略规划上撒察别乞没有长远眼光，只看到了蒙古部本身，尽管他的勇猛和才能不会逊于铁木真，否则也不可能帮助汪罕兄弟、战胜蔑尔乞，被琐尔汗认为是有力量当蒙古汗的首领。

铁木真对时局的判断是合情合理的，蒙古各部自相残杀，金国也不断杀戮蒙古人，当时蒙古人数量不多，还很弱小，要想实现统一是非常艰巨的，邻近金国的塔塔尔、弘吉剌、撒勒只兀惕、合答忻四部力量都很强，其他实力比蒙古部强的也是不少的，很多都称汗了，而乞颜蒙古部自身还分裂着，只能韬光养晦地周旋，哪怕称臣也在所不惜。但是他对撒察别乞也是用权术的，这是历史的局限性造成的，铁木真也是故意压制、削弱这个有能力与他争夺汗位的亲戚。在与铁木真冲突的关系最密切的直系亲戚中，撒察别乞实力最强，他支持铁木真当上蒙古汗，使当时分裂严重的蒙古部族开始凝聚统一，对蒙古民族还是有功的。

撒察别乞的结局也是一个历史之谜，《元史》记载他被打败后，带领家属突围到帖烈图山隘，也没有逃亡到其他部族，数月后被攻灭。可是在数年后铁木真给汪罕的信中，依然称呼他为兄长，说他自己请撒察别乞帮助过汪罕兄弟，也不能排除他被俘后受优待。其他史料对他结局的记载有时也是矛盾的，《史集》说他突出铁木真包围不知去向，又写铁木真说替汪罕杀了撒察别乞，可信度很低。撒察别乞参与帮助汪罕复位，直接救援他弟弟札阿敢布，攻打蔑尔乞惕，是对汪罕兄弟有恩德的，尤其是与札阿敢布关系更应该是密切的。铁木真对撒察别乞不可能赶尽杀绝，毕竟包括木华黎、博尔忽等大量蒙古人都曾是撒察别乞的部属，优待他能笼络人心，况且他是民族感情浓厚，正直的著名首领。

即使札木合那样与铁木真严重对立的人还得到成吉思汗的优待，他们只是安达，撒察别乞与铁木真是手足兄弟，铁木真称他为兄长，两人不是安达，是亲戚。很多历史事实只能推测，但是可以看出两人不是政治立场对立的冲突，撒察别乞与执行反动政策的落后贵族是不同的。撒察别乞是合不勒汗的直系子孙，他的曾祖斡勒是和俺巴孩汗一样被金国钉死在木驴上的蒙古著名人物，他与金国有深仇大恨，他统领的札剌亦儿部也是与金国矛盾最深的部族，他和铁木真冲突也和铁木真执行与金国联合的政策有关，但是这只是政策矛盾，两人没有根本矛盾，铁木真执行的也是权宜政策，不是他的真实立场。琐尔汗提到的四位蒙古首领，除了塔里忽台是欺凌弱小的反动人物，其他三个都有英雄气概。