咸丰初年调处江南军务，在湖南湖北及江南一带立功，荐升直隶大名总镇。这时回人与捻军张总愚欲联合叛乱，朝廷因此改授德昭总兵陕安，以镇慑秦中，随即再补甘肃固原提督。但西安士绅挽留，以保护省城。德昭留兵数月，回人终不得逞。德昭战守兼擅，以游击之师，或解豫皖急危，或扼守潼关要道，或防护蒲水饷区，以一军固中原腹地，一时之间，称其为大河南北之“长城”。同治七年（1868），马德昭协助李鸿章征讨捻军，出谋划策，终至成功。此后他驻防潼关数年，军事平定。同治十二年，上书乞归。皇帝感慨曰：国事不宁，君忘其家，三十多年军旅生涯，卿实劳，今成家可封夫人为一品夫人。并书匾二方，一为“钦赐巴图鲁”，一为“陕甘提督军门第”，另有封一品夫人诰封圣旨一道。德昭谢恩，拜阙还乡，终老于家。潼人思其保境之功，为之立祠奉祀。