附录四:美国政府《大数据研究和发展计划》(6)
全国全科医学科学研究所
传染病代理研究模型(MIDAS) 是一个努力开发计算和分析快速逐渐增长传染病信息的方法,并提供在地方上、州上、国家层面上进行政策模拟的建模结果。而需要在全球范围内收集和整合细粒度的信息,因为公共卫生政策在本地实施,需要进行数据访问、管理、分析和存档。
结构基因组计划 通过发现,分析和传播的蛋白质的三维结构,RNA和其他生物大分子结构,展现自然界的多样性,以促进在生物学,农业和医药的基本认识和应用。全球性的努力,包括美国国立卫生研究院资助的蛋白质结构倡议,传染病结构基因组学中心,在斯德哥尔摩的结构基因组学协会和在日本的理化学研究所系统结构生物学中心。通过努力,由结构生物学知识库在TargetDB主办的中心数据库,协调他们的顺序目标选择。
全球蛋白质数据银行(wwPDB) 是一个收集,归档和高品质的大分子结构数据的库,在这个基础上能及时进行科学的自由分配,代表在生物学方面的研究和教学实验测定大分子结构信息,和进行生物、生物化工,医药教学的卓越数据源。美国部分的项目 (RCSB PDB)由能源部的五个研究院, NIH/ BER和NSF联合英国和日本的参与者共同出资。单一数据库现在包含为80,000大分子结构的实验结构和相关的注释。该网站收到来自140个不同国家每月211000个的独立访问者。网站每月大约有1 TB的数据转移。
生物医学信息研究网(BIRN) 属国内首创,通过数据共享和协作推进生物医学研究,提供了一个用户驱动软件为基础的框架,研究团队之间能够在不同地理和不同类型计算机系统上快速、安全的共享数据,给不同的研究团队服务。
美国国家医学图书馆
集成生物学及内部的信息(i2b2) 旨在创造能够整合和交换医疗保健和生物医学研究数据的方法和工具。通过i2b2开发的软件工具整合、挖掘和表示的数据,能够通过共享开源和开源管理下,在全球50多个组织进行使用。
行为与社会科学办公室(OBSSR)
国家老化计算机化数据存档(NACDA) 通过在老龄上的研究,帮助研究人员从有开发潜力广泛数据集上获得利润。NACD保存和提供美国老龄最大的电子图书数据。
人口研究的数据共享(DSDR) 提供的数据归档,保存,传播和其他数据的基础设施服务。 DSDR朝着一个统一的法律,技术和实质性框架工作,在其中分享人口科学的研究数据。
NIH–NSF联合项目
在计算神经科学的合作研究(CRCNS) 是一个NIH-NSF联合支持的项目,帮助合作研究项目之间的计算科学家和神经科学家促进对神经系统的结构和功能,神经系统紊乱机制和神经系统所使用的计算战略机制的认识。近年来,德国联邦教育和研究部还加入了在德国的方案,并支持研究。
美国国家科学基金会(NSF)
推进大数据科学与工程的核心技术(BIGDATA) 是一个NSF和NIH之间新的联合招标项目,旨在促进管理、分析、可视化和从大量多样分散异构的数据集中提取有用信息的核心技术。具体来说,将会支持对数据的管理、数据分析、与电子科学的合作,帮助在科学、工程、医学技术和工具的开发和评估方面取得突破性的研究和创新,使美国在基础技术上未来保持几十年的竞争力。
用于21世纪科学与工程学的网络基础设施框架(CIF21) 开发,整合,协调,充分利用了一套先进的网络基础设施方案,通过整个国家科学基金会的努力,创造有意义的网络基础设施,以及一体化水平的数据和工具,以支持科学和教育。
NSF通过联合计划 建立一个新的CIF21对综合研究生教育和研究培训实习生的跟踪计划(IGERT)。目的是新一代的研究人员能够解决基本的大数据有关的核心技术和技术的挑战,能够在跨学科进行网络基础设施的教育和支持。
引文数据 能够提供 透明和可持续使用和引用的数据集,由一封联邦政府工作人员发起的信中开始进行资助,反映了联邦政府在基金资助研究数据的管理和可持续发展。
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