最近讨论“马来人种”比较多。那么我想有必要澄清一点，即我这里所说的“马来人种”首先是遗传概念其次才是体质概念，也相当于“新亚洲人”的概念。在遗传上是以Y-O/N，mt-N/R（主要是A、N9、Y、B、F、R9等）为主要标记的人群，在体质上接近现代的东南亚人，但现代的印支-马来人，东南亚人其实大部分都是与尼格利陀人不同程度混杂的人群。

下面我以现代马来人的mtDNA成分来进行分析哪些可能是原始马来人种的成分。见2006年Hill"Phylogeography and Ethnogenesis of Aboriginal Southeast Asians"附件中的数据。

B*/B4/B5a：这是马来人种的基本成分。

E/M9*：不是。M9主要分布在藏族人和日本人中，因此显然不是马来人种的主要成分。而根据"Climate change and post-glacial human dispersals in Southeast Asia"一文，E大约3.3万年前从M9中分离出来，分化地点很可能就在印支-马来半岛。主要出现在在马来人中，Semang/Senoi人中未见，因此可确定是古南亚底层成分。

R9*/F1a/F4b:是。

N*/N21/N22：可能是。根据最近泰国和越南人的论文来分析应该是印支-北部湾起源的早期成分。

N9a/Y2：是。

M*：M*集中分布在云南、藏南和印支半岛西部等地，因此不是马来人种的原初成分。主要出现在在马来人中，土著人Semang/Senoi中很少见，因此是早期混杂的古南亚底层成分。

M21/M22：不是。主要出现在Semang/Senoi中，在马来人中较少见而且分布不均匀。是尼格利陀人的原始成分。

R21/R22：不是。主要出现在Semang/Senoi中，在马来人中较少见而且分布不均匀。是尼格利陀人早期混入的N*/R*成分。

M7*/M7b/M7c：考虑到M7的分支M7a、M7b2等独特支系分布在日韩、阿伊努人中，因此不是马来人种的原初成分。很可能是起源于印支-北部湾的古南亚成分。出现在在马来人中，Semang/Senoi人中未见。

其它（各仅见一例）:I、U7应该是印度晚期移民成分。Z是东亚移民的底层成分。

综上所属，马来人的母系基本成分可以分成以下4类：

原始马来人种成分：B*/B4/B5a、R9*/F1a/F4b、N9a/Y2、N*/N21/N22？
远古时期混入的古南亚底层成分：M*、M7*/M7b/M7c、E/M9*
晚期扩张时同化的尼格利陀人成分：M21/M22、R21/R22
其他晚近外来移民成分：I、U7、Z

附：

1.泰国清迈人的mtDNA论文
Forensic and phylogeographic characterization of mtDNA lineages from northern Thailand (Chiang Mai)
Bettina Zimmermann & Martin Bodner & Sylvain Amory & Liane Fendt & Alexander Röck & David Horst & Basil Horst & Torpong Sanguansermsri & Walther Parson & Anita Brandstätter

从附件的数据看，我之前发现的N-16111,16172,16189,16362对应N-5581-4562；另外在清迈人中还发现N-5581-4977，这样看来它们应属同一未命名的单倍群N-5581。而我发现的N-16263,16274,16343,16357属于另一N*小支。清迈人中还发现pre-N22。
综上所述，东亚和东南亚的绝大部分N*支系都源自印支半岛。

2.越南人的mtDNA控制区序列
Mitochondrial control region sequences from a Vietnamese population sample
Jodi A. Irwin & Jessica L. Saunier & Katherine M. Strouss & Toni M. Diegoli & Kimberly A. Sturk & Jennifer E. O’Callaghan & Carla D. Paintner & Carsten Hohoff & Bernd Brinkmann & Thomas J. Parsons
从附件数据中可以看到几个未定义的N*，与泰国北部清迈人比较可以发现：其中存在pre-N22和N-5581-4977。这样看来泰国清迈人的N*罕见类型很可能仍属于北部湾起源。