链孢霉污染主要出现在高温季节生产食用菌菌种、菌棒过程中。由于其长速度极快，而且后续污染较重，一旦处理不当，原培养室很可能成为新的污染源，甚至报废，直至数年后彻底清理、杀菌处理后，才再启用。

    主要处理措施有：首先，严格检查。接种后的菌袋，几天后即可例行检查，发现有链孢霉污染迹象时，应及时剔出菌袋单独处理。其次，发现袋口长出橘红色链孢霉孢子团时，不可随便移动，可采取三种方法：一是使用塑料袋，自上而下轻轻套住污染袋，慢慢移出培养室，不可使气流移动很大；二是用废布浸透废柴油或机

油，将污染袋轻轻包住，之后再移出培养室。三是将菌袋上已经污染的部位用小刀切除，然后使用“菇老爷”牌链孢克星每瓶兑水50公斤，将药水盛装在容器中，将已经切除污染部位的菌袋放在链孢克星药水中浸泡一下，拿出即可。

   再次强调，移出室外的污染袋，最好经灭菌处理后再焚烧或深埋。对污染较轻的可再利用。

  需要注意的是：一旦发生链孢霉孢子团后，千万不要对其直接喷药，因为其孢子将会借助喷雾气流四处散发，形成扩散性污染；一旦扩散、蔓延、后果不堪设想。另外，发生链孢霉污染的培养室，不能使用扫帚扫地，清理卫生时，宜用带药水拖布进行擦洗，最好能单独兑配药物进行擦洗（可以将链孢克星每瓶兑水30公斤左右），以强化杀菌结果。

  对于菇房的处理方法是：间隔3-4天使用“菇老爷”牌链孢一熏净熏蒸一次菇房，可以有效的控制链孢霉的蔓延。