在医疗界钻研新的药物与疫苗对抗病菌的同时，另有研究人员把粪便视为良药，他们的研究或许会使得粪便库变得同血库、精子库一般普通。

　　医疗界主要是取粪便中的细菌来治病，对抗一种叫做“难辨梭状芽孢杆菌”（Clostridium difficile，简称C. diff）的病菌。在美国，每年约有300万人感染这种病菌，其中约50万人会腹绞痛、发烧、腹泻、结肠发炎等症状，这群人半数以上年过65岁。

　　美国每年有多达3万个病人因感染此菌而丧命。

　　研究者相信，“难辨梭状芽孢杆菌”病例多是滥用抗生素所致。这是因为，抗生素杀灭了结肠中原本能抑制这种毒菌的益菌。

　　根据实验数据，粪菌治疗的成功率介于85%至90%。美国疾病控制与预防中心的流行病学家麦克唐纳说：“此法可能在一两年内便会成为治疗多发病患者的主要疗法。”

　　早在1958年就有四名病人接受了粪菌移植，治疗结肠发炎；在八十年代，澳大利亚肠胃病学家布罗迪(Thomas Borody)用此法对抗“难辨梭状芽孢杆菌”之后，粪菌移植引起更多人注目。

　　现今，医生们通过将稀释过的粪便分离，最终获得了无臭、白色的菌液，用以移植。移植法包括口服、由鼻子插管进入十二指肠把菌液注入、通过管道沿胃镜钳道注入到消化道、用肠镜在大小肠交接处注入菌液、灌肠。