赛里木湖湖溶解氧绝对含量高于艾比湖，这主要与海拔高度、水温及湖面上氧分压有关。

    【化学耗氧量】湖水中有机物含量的多少，通常以化学耗氧量（CODcr）表示。湖体中化学耗氧量平面分布上有差异，湖心最小，东部和南部的含量高出西部和北部近一倍。

【总氮和总磷】总氮包括有机氮和无机氮（NH₃-N、NO₂-N 和NO₃-N）。湖水中以无机氮为主，占总氮的57.5%．有机氮占42.5%。无机氮在湖水中以氨态氮存在形式为主，硝态氮次之，亚硝态氮含量最低。与20 世纪90 年代相比，总氮含量有所增加，而总磷却有所减少。

    总氮和总磷平面分布状况较一致，即湖的东南较高，西北较低。总氮、总磷含量湖东南部分别为0.44mg/L 和0.022mg/L，西北部分别为0.39mg/L 和0.019mg/L。这与湖水草茂盛和人工饵料有关，西部和北部的水草生长过程中吸收了氮、磷营养物质。湖东南部则水草少，投放人工饵料多，故而氮、磷含量都比较高。此外，氨、磷这两种营养成分是限制藻类生长繁殖的因素。

一般来讲，藻类生长对N∶P 比要求在10∶1~15∶1 范围内，当N∶P>15 时，表明藻类生长受到磷的限制，氮的供应充分；当N∶P<10 时，则表明藻类生长受到氮的限制，而磷供应充分。赛里木湖总氮、总磷的测定结果比值为N∶P=20，表明赛里木湖的藻类生长受到磷的限制。 

【形成演变】根据地理中国杂志与中国中国电视台推出的《赛里木湖之谜》及《干旱区地理》杂志资料：赛里木湖位于伊利盆地谷地，是天山造山带中的山间盆地，与其直接邻接的南北构造单元分别为哈尔克——那拉提中、南天山板块间的早、中古生物带碰撞造山带（简称哈——那带）与科古琴——波罗特奴早、中古生代造山带（简称科——博带），在大地构造上属于天山造山带中的伊犁——中天山微地块。