民国元年（1912年），沿袭清末旧制，阿尔泰地方仍直属中央政权管辖。民国八年（1919年），阿尔泰地方划归新疆省，设阿山道。是年设布尔津县，喀纳斯地域隶属新疆省阿山道布尔津县。

    新中国成立后，1980年，新疆维吾尔自治区人民政府批准设立喀纳斯自然保护区。