明永乐五年（公元1407年），郑和第一次下西洋顺利归来，明成祖朱棣为感谢天妃保佑海上平安，赐建“龙江天妃宫”于狮子山麓。永乐十四年（公元1416年）朱棣又为天妃宫题写《御制弘仁普济天妃宫之碑》一文。据记载，“天妃宫前后殿宇、房屋七十九间，周围外墙计一百八十一丈余”。

    清咸丰以后，天妃宫屡遭毁坏，昔日宏丽荡然无存。1937年冬，日军侵占南京城，天妃宫再次全部毁于战火之中，仅存天妃宫碑。1996年扩建“静海寺旧址”时，将天妃宫碑移至静海寺内。为纪念郑和下西洋600周年，于2004年底重建南京天妃宫，它恢复了明代龙江天妃宫的恢宏气势，成为吸引海内外各界人士祈求福祉之圣地。