绿营编为标、协、营及汛。士兵为世兵制，父死则子继，由汉人统帅。绿营的官阶大致上依照明朝的制度，由高至低分别为提督(省/标)、总兵(镇)、副将(协)、参将(营)、游击、都司、守备(地方)、千总(驻点)、把总。提督全名为“提督总兵官”，统领一省绿营，受文官总督、巡抚所节制。各省兵力大小不一，由万余到六七万不等；提督之下为总兵，主管一镇的绿营，兵力从千人至两三千人不等；再下面的为副将，管理一协的兵力，约数千人左右；副将以下就是参将、游击、都司、守备，所统辖的称为营，兵员数量各有不同；在最下面的为千总与把总，负责统领一汛，也就是一个驻地，士兵由十数名到上百名都有，后来更设有“外委千总”与“外委把总”，设在他们之下，职位与千总、把总相同，但薪俸较低。另外，从总督到总兵都有自己直属的绿营兵，称作“标”，如“督标”（总督）、“抚标”（巡抚）、“军标”（四川、新疆将军）、“提标”（提督）、“镇标”（总兵）等，大小和协相同。“标”的统领官称“中军”（地位相当于现代的卫队队长及副官长），督标中军由副将担任，抚标中军由参将担任。各省绿营分以镇为最高战略单位，以营最基本单位。按照《乾隆大清会典则例》，清代中叶全国绿营分为66镇、1169营（其中标营336个、同城协营6个、同城营44个、分防协营169个、分防营614个），兵员共计648,345人，分布在内地十八省各城要害。

绿营兵多为步兵，亦有马兵与水兵，马兵为骑马的部队，步兵为步行的部队，守兵为后勤部队，马兵和步兵又统称为战兵。常用武器有刀、枪、矛、箭，也有少数如鸟枪、铳枪、抬枪甚至大炮，但装备与待遇明显比八旗差。到康熙年间绿营已成为一个严密的制度，将兵由兵部直接统辖，将领无法直接统兵，兵卒平时分派各地作为差役，战时才临时分发给将领，将不知兵、兵不知将，有效地防止军人拥兵自重。