《合金装备：原爆点》除营救人质基科和帕兹两个主线任务之外，还有四个支线任务和两个隐藏关卡，完成主线任务后四个支线任务即可解锁，然而还有两个隐藏关卡（似曾相识、雷电来袭）需要在主线任务的关卡中收集全部徽章才能解锁。

徽章共有九枚，前八枚位置分别在任务一开始玩家身后的悬崖边上、关押基科的区域正门、东面撤离点移动路上的岗亭顶上、北侧停机坪的中央偏东区域、停机坪东北方向的下水道口、北侧基地右边门的房顶上、中央地带三个大房顶仓库北面护栏围起来的电箱区一个箱子上、西侧蒙古包的一堆垃圾处。第九枚比较特殊，四处寻找是绝对找不到的。

其实第九枚就在自己身上，是爬上悬崖的时候掉到背后的，可以通过在地上翻滚将它甩下来。我用的方法是：在行政楼的地下设施里救出人质帕兹后，扛着她回到开场时玩家出现的地方，放下人质，进入匍匐状态趴下后举枪瞄准，同时按住Shift键和左方向键、Shift键和右方向键翻滚，翻几圈儿，就能把它抖出来了。拿到了最后一枚徽章，呼唤直升机，将帕兹抱上直升机，自己也上去，任务完成，隐藏关卡解锁成功。

剩下的四个人质与任务没有关系，救不救都可通关。若玩家有“强迫症”的话，那就“搂草打兔子”吧，或在救基科时将他们一起送上直升机，或重新返回营地东边的囚笼区将剩下的四个人质扛到着陆区（撤离点），然后呼唤直升机，并将他们送上直升机一同撤离。