畜牧业是与农业联系最密切的部门，古埃及发展了人类历史上最早的畜牧业，从第一王朝开始牲畜作为战利品就大量的被记载在各种文物上，尽管在数量上有很多被夸大的成分。

在古埃及留下的墓室壁画中我们经常可以看到公牛犁田、绵羊踏种、驴子在打谷场上践踏谷穗运送收割的麦子的场景。从古王国开始，牛和驴子已经成为长途运输最重要的手段。在王家大型工程建筑中它们也被用来运载沉重的史料。羚羊、瞪羊、大角山羊也开始被驯养。

希罗多德记载了古埃及人杀猪和烧烤的过程，以及如何用于祭祀和使用的情况，尽管当时的埃及人也认为猪是不洁之物。

古埃及的贵族家庭出现了专门饲养鹅、鸭、鸽子以及鹤类等家禽。在普塔霍特普的墓室中记载了大量家禽的数目，牲畜逐渐成为财富的重要标志之一，并且成为国家的重要税收来源。在《巴勒莫石碑》的记载中，国家除了定期清查“黄金和土地”之外，还定期清查牲畜，留下了“第三次清查大牲畜”的记录。

在三角洲和法尤姆地区渔猎逐渐成为日常生活的一部分，第五、第六王朝的贵族墓室中留下了许多古埃及人用网捕鱼、用鱼钩钓鱼以及猎杀河马的场景。

根据希罗多德的记载古埃及的僧侣是不能吃鱼的，鳄鱼作为圣兽在底比斯和发尤姆地区也是被禁止食用的，但是在厄勒藩汀地区人们食用。希罗多德记载了古埃及人除了吃烧烤和煮熟的鱼，还食用生鱼，晒干的鱼以及盐水盐渍过的鱼。现在的埃及人也喜欢讲整个鱼直接进行烧烤，然后剥掉鱼鳞食用。

古埃及的贵族经常把狩猎作为日常娱乐的一种形式，猎取的对象包括狮子、豹子、羚羊等。著名的第三第四王朝时代的梅滕的职务中就包括“牧人的管理者”和“猎人的长官”两个头衔。