按照岛内与周边区域联动发展、优势互补、分工明确的原则，立足平潭岛内现有基础，明确区域功能，统筹平潭与福清、长乐的发展布局，有序推进岛内开发建设，形成区域协调、产业配套、功能互补、相互促进的空间布局。
　　“一岛”：即平潭主岛，重点发展高新科技、商贸加工、海洋产业、现代服务、旅游休闲等，开展两岸产业、城市及文化教育的深度对接和交流合作，是开展两岸合作先行先试前沿平台及构建两岸人民共同家园的主体区域。
　　“两区”：与平潭毗邻的福清市和长乐市，为实验区周边依托区域，重点是依托福清江阴港区和长乐空港工业集中区，定位为与平潭主岛相配套、作为岛内产业延伸及经贸活动互补的依托腹地。江阴保税港区作为近期平潭开发的重要港口中转地及物流集散地，临港产业区重点发展重化、装备制造等临港产业；长乐空港工业集中区重点发展临空产业及空港物流业，以及电子信息、机械制造、新材料等高新技术产业。