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[转载]也谈叶绿素结构式的书写

(2020-06-04 10:41:26)
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分类: 物质结构疑难

也谈叶绿素结构式的书写

在以前的无机化学教学中,并不涉及无机元素的生物学效应问题。所以对于像叶绿素这样比较重要的分子结构情况,大家也几乎没有怎么关注过。

但是,现在的中学教学中就出现了这个分子。并且其分子结构式还有多种不同的写法。这就给化学教学带来了一定的困难。

这当然是由于,一些教师对结构式还不能规范地书写,且对某些化学键的成键情况还不够清楚的缘故。

一、 几种常见的叶绿素a分子结构式

叶绿素a的分子式为C55H72MgN4O5,这已是大家公认的了。

学生往往会对这个分子式的写法不满意,为什么不把其中电负性最小的Mg写在分子式的最前面呢?

这可能是由于,这个分子的主要部分是一个杂环化合物,属于有机化合物的讨论范畴。要按有机物分子式的写法,顺次突出CH元素、把其余元素写在后面,这才是最为重要的。

在网上可以看到一些叶绿素a的分子结构式。如下面的图一、图二、图三、图四。

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即便是在不同版本的中级无机化学教材中,其书写的形式也多有不同。如下面的图五[1]、图六[2]

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综合上面的6个结构式,可以看出它们间的区别主要有两点。

一是,中心的镁要写为Mg原子还是Mg2+离子,也就是它是否还要带有电荷。

二是,Mg与周围N原子间的化学键有几个,它们应该如何来表示。

要解决这两个问题,当然离不开对其组分结构的分析。

二、脱镁叶绿素a的结构

叶绿素a是如何构成的,也就是如何被衍生出来的呢?不妨让其脱去其中的Mg2+离子。

在网上还真的可以找到“脱镁叶绿素A”,这种化学物质。其分子式为C55H74N4O5。其结构式如下图七。

将脱镁叶绿素A的分子式C55H74N4O5,与叶绿素a的分子式C55H72MgN4O5,两相比较。不难看出,两者间只是相差了两个H原子,与1Mg原子。

也就是说,一个Mg原子取代了“脱镁叶绿素A”中的两个H原子后,就得到了叶绿素a

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至于脱镁叶绿素AN原子的成键情况,与有机化学教材中杂环化合物——(读作雷)环结构(图八)里4N原子的成键情况,竟然是完全一样的 [3]

这样,再强调一下环类物质中的原子成键情况,及分子结构的几个特点。那就很有必要了。

第一,如上环中所有C原子和N原子,全都采取的是sp2杂化,这些原子都处于同一个平面上。且形成了一个遍及这所有24C原子和N原子的大π键。

第二,环中的4N原子是不同的。它们的位置两两相对。左上与右下的两个N原子没有参与双键形成,可以称为“氨基”。而右上与左下的两个N原子参与了双键的形成,可以称为“亚氨基”。

这两种N原子的成键情况是不同的。因为氨基上还有一个可以电离出去的H原子,可以使这个N原子带有负电荷。而亚氨基上没有可供电离的H原子,不会可能带有负电荷。

第三,该结构中已有4个五元环,只要中心再有一个能够与N成键的原子,就可以再构成4个更为稳定的六元环。

成更多的六元环,就是环中心可以再结合一个原子的化学反应原动力。

所以,应该把叶绿素a的形成过程假想为这样的两步:

第一步,中性的脱镁叶绿素A分子C55H74N4O5,先脱去2个氨基N上的H+离子,成带有2个负电荷的C55H72N4O52-离子。

要知道的是,由于环中有一个遍及整个平面的大π键。这2个负电荷,也不会固定在某一原子上,而是要归属于整个原子团。或者说,在其中的大π键上。

第二步,这个带有两个负电荷的脱镁叶绿素A离子C55H72N4O52-,再与一个Mg2+离子结合成电中性的叶绿素a C55H72MgN4O5

 

这样,整个叶绿素a分子才会表现为电中性。

从叶绿素a分子不会带电的角度来看,图二与图五都是不规范的。因为它们把中心Mg2+离子的2个正电荷标记出来了,却没有写出C55H72N4O52+离子的2个负电荷。会给人以,叶绿素a是个离子,而不是分子,这样的假象。

如果一定要标出Mg2+离子的2个正电荷,及C55H72N4O52+离子的2个负电荷。那就只好从其生成过程来考虑了。也就是在环中2H+的脱除部位来作“标记”。如下图九。

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(其中的负电荷是用红色短横来标记的)

2个负电荷这样标记出来,整个叶绿素a分子才会显示为电中性。

三、脱镁叶绿素离子与镁离子间成键情况的表述

从形成离子化合物的角度来看,图九似乎已经就是叶绿素a的结构式了。因为在结构式中的离子键,只要标记出电荷就可以,是不能用短线来连接的。

这样看,在Mg2+离子与本应带有负号的氨基N原子间不能有短线。所以,图四也是错误的。

很明显地,叶绿素a不会是离子化合物。因为,基本属于离子晶体的Mg3N2,在水中是极不稳定的。换句话说,MgN间的离子键,不可能在有水、这样的自然环境下形成。

 

叶绿素a也不会是共价化合物,因为Mg原子不可能有那么高的化合价。

这样看,在叶绿素a中的4N原子只能是各提供一个孤电子对,给Mg2+离子的经过杂化后的4个空轨道。来形成一个更为稳定的电中性配分子。其中的4个化学键均为配位键。

4个完全一样的配位键,要如何在这个分子结构式中被反映与表示出来呢?

再用短线来表示这些配位键,那肯定是不行的。因为在结构式中,已经用短线来表示共价键了。配位键与一般的共价键间,应该有所区分。

这样看,图一、图四中用的就是与共价键一样的“短线”,都不合适。

用箭号“→”来表示这些配位键,是否可以呢?考虑到在价键结构式中,“→”常常用来表示,某原子单方面提供一对电子给另一原子,以便成使其成8电子稳定结构。由此,学生也容易产生出“金属Mg2+离子怎么需要那么多电子”,这样的疑问。

看来,在MgN间还是画虚线,最为合适。

用这个标准来看前面的6个图,只有图三中MgN的成键情况表现的比较好。

但是,图三中似乎又出现了,分子中的氨基N原子与亚氨基N原子,位置被调换了的问题。

看来,写出一个没有任何错误的叶绿素a结构式,还真的是很难。

如果是,既要表现出叶绿素a分子是一个电中性的配分子,还要表现出其中心是个Mg2+离子。可以考虑的书写方法,似乎应该是如下的图十。

[转载]也谈叶绿素结构式的书写

在这部分知识的教学中,教师还应该给学生指出,叶绿素a属于一类特殊的配合物。即,它是一个相当稳定的螯合物。

原因在于,脱镁叶绿素a离子是一个有着4N配原子的4齿配体。当它与Mg2+离子结合时,会构成4个六元螯环。这些螯环还受到4个五元环的支撑,及一个大π键的固定。

Mg2+离子很难从脱镁叶绿素a离子的这种控制下“挣脱”出来。因为这4个配键同时断裂的几率是极小的。

参考文献

[1] 唐宗薰. 中级无机化学. 高等教育出版社. 2003

[2] 朱文祥等. 中级无机化学. 北京师范大学出版社. 1993

[3] 吉林师范大学等校. 有机化学. 人民教育出版社. 1980

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