如何理解核糖体的沉降系数?

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疑难问题:在了解核糖体时总时会碰到沉降系数(s),什么是沉降系数?如何理解它的数值?
核糖体(Ribosome),是核糖核酸蛋白体的简称。是细胞器的一种,为椭球形的粒状小体,原核与真核细胞蛋白质合成的部位。
一、什么是沉降系数?
沉降系数(s)为大分子物质在超速离心沉降中的一个物理学单位,可间接反应相对分子质量的大小。根据在超速离心机的离心时的沉降情况获取,数字代表沉降系数值, S数值越大核糖体也就越大。
用离心法时,大分子沉降速度的量度,等于每单位离心场的速度。
计算式:s=v/ω2r,s是沉降系数,ω是离心转子的角速度(弧度/秒),r是到旋转中心的距离,v是沉降速度。
沉降系数通过分析离心机测定。
沉降系数以每单位重力的沉降时间表示,并且通常为1~200×10-13秒范围,10-13这个因子叫做沉降单位s,即1s=10-13秒,如血红蛋白的沉降系数约为4×10-13秒或4s。
大多数蛋白质和核酸的沉降系数在4s和40s之间,核糖体及其亚基在30s和80s之间,多核糖体在100s以上。
二、核糖体的沉降系数
真核和原核的核糖体的沉降系数不同,根据沉降系数也可以区分核糖体的不同亚基。
由于沉降系数不同,核糖体又分为70S型和80S型。
70S型核糖体主要存在于原核细胞及叶绿体、线粒体基质中,其小亚单位为30S,大亚单位为50S。50S大亚基含有34种不同的蛋白质和两种RNA分子,相对分子质量大的rRNA的沉降系数为23S,相对分子质量小的rRNA为5S。0S小亚基含有21种蛋白质和一个16S的rRNA分子。
80S型核糖体主要存在于真核细胞质中,其小亚单位为40S,大亚单位60S。真核生物的rRNA分四类:5SrRNA、5.8SrRNA、18SrRNA和28SrRNA。
表格取自于《细胞生物学》(翟中和)
三、为什么核糖体的沉降系数不等于大亚基与小亚基沉降系数之和
解释一:离心的介质并不是均一的,在重力的影响下,介质是呈一个密度梯度,所以不同相对分子质量的物质在介质中的位置并不是线性关系。
解释二:这些数据都是测出来的,沉降系数不是简单的相加。原因可能是50s和30s的蛋白质组合在一起,空间结构发生变化,最后测出来的数据就是70s。