DNA连接酶能不能催化连接平末端?

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dna连接酶粘性末端平末端磷酸二酯键教育 |
分类: 疑难问题的解决 |
分析:此题和得分率只有28.3%,是选择题中最低的,说明学生在这方面还有欠缺。上述试题由于讲清楚是限制性核酸内切酶 EcoRⅠ,所以不会催化平末端的连接。
常用的DNA连接酶有两种:来自大肠杆菌的DNA连接酶和来自噬菌体的T4DNA连接酶。二者的作用机理类似。
1.大肠杆菌的DNA连接酶
DNA连接酶在大肠杆菌细胞中约有300个分子,和DNA聚合酶Ⅰ的分子数相近,这也是比较合理的现象。因为DNA连接酶的主要功能就是在DNA聚合酶Ⅰ催化聚合,填满双链DNA上的单链间隙后封闭DNA双链上的缺口。这在DNA复制、修复和重组中起着重要的作用,连接酶有缺陷的突变株不能进行DNA复制、修复和重组。
另外,NH4Cl可以提高在大肠杆菌DNA连接酶的的催化速率,而对T4DNA连接酶则无效。
2.T4DNA连接酶作用机制:
(1)T4DNA连接酶与辅助因子ATP形成酶-AMP复合物。
(2)酶-AMP复合物结合到具有5’-磷酸基和3’-羟基切口的DNA上,使DNA腺苷化。
(3)产生一个新的磷酸二酯键,把缺口封起来。
分子生物学试验中主要采用T4DNA连接酶,因该酶在正常条件下,即能完成连接反应。T4 DNA 连接酶能催化双链DNA上相邻的3ˊ羟基和5ˊ磷酸末断形成磷酸二脂键。
T4DNA连接酶连接要求和结果
外源DNA末端性质 |
连接要求 |
连接结果 |
不对称粘性末端 |
两种限制酶消化后,需纯化载体以提高连接效率 |
载体与外源DNA连接处的限制酶切位点常可保留;非重组克隆的背景较低;外源DNA可以定向插入到载体中。 |
对称性粘性末端 |
线形载体DNA常需磷酸酶脱磷处理 |
载体与外源DNA连接处的限制酶切位点常可保留;重组质粒会带有外源DNA的串联拷贝;外源DNA会以两个方向插入到载体中。 |
平末端 |
要求高浓度的DNA和连接酶 |
载体与外源DNA连接处的限制酶切位点消失;重组质粒会带有外源DNA的串联拷贝;非重组克隆的背景较高 。 |