Gaussian输入文件示例

作者：shims

最常用的量子化学软件估计是Gaussian了，其友好的图形界面是非常适合初学者学习使用的。在Linux系统中，Gaussian软件的输入文件是以.com为扩展名的文件，输出文件会默认以.log结尾。在Windows系统中，Gaussian软件输入文件是以.gjf为扩展名的文件，输出文件默认以.out结尾。需要注意的是，虽然默认情况是这样的后缀名区分，不过也可以根据自己的情况适当做更改，特别是在Linux系统上的文件本身就不是按照后缀名来区分文件。

下面简单介绍一下Gaussian的输入文件，输入文件示例如下：

#P TEST STO-3G COMPLEX pop=full scf=tight

Gaussian Test Job 01

SINGLET DELTA STO-3G//STO-3G DIOXYGEN

 0 1

 O

 O 1 R

R 1.220

第一行以#开头，是Gaussian任务运行说明行。#表示默认的输出信息；#T表示只打印重要的输出部分；#P表示打印更多的输出信息。在其后是任务类型说明内容，一般包括人物类型（默认单点能），方法和基组（STO-3G）以及其它的任务说明关键词（COMPLEX、pop=full 、scf=tight等）。

第二行为空行，在任务说明行与任务说明行之间的空行是必须的。

第三、四行是对于这个任务的描述，根据自己的需要标记任务说明。任务说明一行写不下可以分多行写，不过需要注意，在任务说明行之后一定要有空行分隔。

第五行为空行，在任务说明与分子电荷与自旋多重度行之间，该行是必须的。

第六行一般是两个数字，第一个数字表示整个分子的电荷，第二个数字表示整个分子的自选多重度。如果后面分子说明部分将分子分为了多层的话，这里也会分别列出各层的电荷与自旋多重度。

第七行以后是对于分子几何结构性质的描述，描述可以采用多种方法，如笛卡尔坐标、内坐标。也可以将键长（R）、键角、二面角使用字母标识，并在分子说明的后面单独列出（R 1.220），该方法一般适用于内坐标而不适用于笛卡尔坐标。笛卡尔坐标一次列出各个原子名称，X、Y、Z坐标值，一行一个原子。有些特殊的任务会在分子说明之后添加更多的说明字符。如果是接着上一步计算的话则不需要分子说明部分，而是从前一步的chk文件直接读取。

在分子说明之后一般会预留两行空行，这个主要是部分版本的Gaussian软件需要有两行的空行才能计算。

不同的任务会使得Gaussian输入文件不同，请根据自己gaussian任务需要编写输入文件。