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嚴實,分子人類學硏究者,語言愛好者,現在復旦大學現代人類學教育部重點實驗室工作。推薦《人類學雜記》系列。長期接收Y染色體測試樣本,詳見http://www.ranhaer.com/thread-14446-1-1.html
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終於在學術雜誌上又發出了一篇我有重要參與的文章,文章已經確定被NSR(National Science Review,中國《國家科學評論》)接收。文章的作者都是復旦大學金力院士團隊的,包括金院士,還有張夢翰、我和鄭鴻翔三個博士。文章的主筆人是張夢翰博士,他是數學背景出身,統計學功底很好,在潘悟雲敎授門下讀了語言學的博士,畢業以後又到了現代人類學實驗室作了博後。我是主要做Y染色體的,同時也是語言學愛好者。而鄭鴻翔博士是線粒體方面的專家。硏究人類歷史,語言和遺傳都是重要的硏究材料,我們這樣一個團隊也就正好湊夠了人來硏究,人類的語言和遺傳到底有什麼樣的關聯。

我們的文章鏈接在這裏:http://dx.doi.org/10.1093/nsr/nwy083
中文新聞稿在這裏: http://life.fudan.edu.cn/Data/View/3079
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演化

分类: 人類學雜記

這一陣在算樹。做樹方面有一個四物種分析的基礎知識:即只有三個物種的話,演化樹可能的拓撲形狀只有一個,反正就是一個三叉(圖1)。

 

圖1,三物種的樹X圖1,三物種的樹

 

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分类: 人類學雜記
(溫馨提示:簡化字版本見後。此外文章裏面有一些偏技術性的內容,暫時看不懂的話先忽略就好,以後接觸到了再去理解不遲。)

目前,中國歷代皇族裏,愛新覺羅家族的Y染色體已經確定,是C2b1b2a-F14751下面的,屬原先的C3北支即現在的C2b-F1396,和成吉思汗以前的黃金家族C2b1b1-F3796較近(見《人類學雜記 39》)。除此以外,朱明皇族和耶律家族目前已知有一些證據,但仍然沒有定論。

我接下來希望能確定的是趙宋皇族的Y染色體。趙宋皇族指太祖趙匡胤和太宗趙光義之父趙弘殷的後代。北宋自太宗之後,直到徽宗、欽宗的歷代皇帝,以及南宋的開國皇帝高宗,都是太宗的後代。但太宗支在靖康之難後所剩無幾。高宗無嗣,南宋從孝宗開始,皇位分屬於太祖趙匡胤的兩個兒子德芳、德昭兩人的後代。宋朝皇室普遍人丁不很興旺,皇位父子相傳最多三代,之後就需要由旁支入繼。此外太祖和太宗的弟弟,魏王趙廷美也有較
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日語

柧┰

重音

分类: 語言

本文爲學習筆記,原文是英文版的原口莊輔(Shōsuke Haraguchi)的Accent一文。


因爲原文還包括了日本各地聲調特徵的一個總結及大阪話聲調的詳細描述,這裏我就不作翻譯了,有興趣的可以自己找來看。我只記一下東京話的聲調特徵。

首先是一般的中文日語課本都會講的音拍與音高問題。日語的一個簡單假名、拗音以及撥音ん、促音っ都算一個音拍。於是,一個漢字的音讀都是一個或者兩個音拍的:こ是一個音拍、こう是兩個音拍、こく是兩個音拍、こっ是兩個音拍、こん是兩個音拍,しゃ是一個音拍、しゅう是兩個音拍,這樣。

然後是基本的調形。東京話有如下規律:

一、一個音拍只能爲高調或低調,不可能有升調或降調;

二、一個文節(ぶんせつ,即一個詞連同後面的後綴部分)中只能有一個連續的高調段,所以一個文節(不攷慮單音拍的文節)的調形只能是HL、LH、LHL(L爲低調、H爲高調

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源基因(www.yoogene.com)本次Y-STR測試中,遇到據信族譜所記共祖在20代之內的兩人,在DYS385位點上,A樣本爲13,13,B樣本爲13,17。兩人另有兩個STR位點各有一步突變。

我們檢査了峰圖,確定檢測結果無誤。但兩人3個位點可以解釋爲僅有3步突變(與20代內共祖不衝突),其中DYS385位點13,17和13,13結果閒並非通常的STR長度變化,而很可能爲Y染色體的“轉化”(conversion)突變,從13,17一步直接變爲13,13。





對於常染色體,在減數分裂或者染色體修復時,可能發生同源重組(recombination)現象
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杂谈

標題:如何判斷我們的“直系祖先”是本土還是非洲來的——回應高星敎授


摘要:非洲之外的現代人常染色體裏僅有約2%的非洲之外古人類混合,我認爲“多地區連續進化附帶雜交”提法不合理,而是絕大多數爲走出非洲、少量爲融合的古人類成分。同時,我也對古代樣本的定年有所疑惑,希望能夠得到解答。


(說明:本文原寫於2017年2月份,因爲在某雜誌發表的問題拖到現在,纔在得到該雜誌的同意下發表於本人的自媒體,時效性有所損失。)


社科院古脊椎與古人類所的高星敎授在2017年1月發表了《尋找我們的直系祖先——真相與謬誤》(http://mp.weixin.qq.com/s/Yb5N5ALqLxK_jC6WL4C3Vg )一文,對現代中國人的起源問題作出了深刻的探討,且對近年來攷古學及分子人類學在人類演化方面的進展作了詳細的梳理。我作爲復旦大學現代人類學實驗室的後輩科硏人員,謹代表個人,從分子人類學的角度對高敎授的觀點提出一些探討和補充。希望大家摒棄學科與門戶之見,綜合各方的證據,攜手探究人類演化史的眞相。而爭論幾年前證據不足時誰對誰錯並沒有必要,因爲科硏工作者都不是神仙,每個人發表看法時也只能基於自己看到

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杂谈

標題:如何判斷我們的“直系祖先”是本土還是非洲來的——回應高星敎授


摘要:非洲之外的現代人常染色體裏僅有約2%的非洲之外古人類混合,我認爲“多地區連續進化附帶雜交”提法不合理,而是絕大多數爲走出非洲、少量爲融合的古人類成分。同時,我也對古代樣本的定年有所疑惑,希望能夠得到解答。


(說明:本文原寫於2017年2月份,因爲在某雜誌發表的問題拖到現在,纔在得到該雜誌的同意下發表於本人的自媒體,時效性有所損失。)


社科院古脊椎與古人類所的高星敎授在2017年1月發表了《尋找我們的直系祖先——真相與謬誤》(http://mp.weixin.qq.com/s/Yb5N5ALqLxK_jC6WL4C3Vg )一文,對現代中國人的起源問題作出了深刻的探討,且對近年來攷古學及分子人類學在人類演化方面的進展作了詳細的梳理。我作爲復旦大學現代人類學實驗室的後輩科硏人員,謹代表個人,從分子人類學的角度對高敎授的觀點提出一些探討和補充。希望大家摒棄學科與門戶之見,綜合各方的證據,攜手探究人類演化史的眞相。而爭論幾年前證據不足時誰對誰錯並沒有必要,因爲科硏工作者都不是神仙,每個人發表看法時也只能基於自己看到

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摘要:非洲之外的現代人常染色體裏僅有約2%的非洲之外古人類混合,我認爲“多地區連續進化附帶雜交”提法不合理,而是絕大多數爲走出非洲、少量爲融合的古人類成分。同時,我也對古代樣本的定年有所疑惑,希望能夠得到解答。

(說明:本文原寫於2017年2月份,因爲在某雜誌發表的問題拖到現在,纔在得到該雜誌的同意下發表於本人的自媒體,時效性有所損失。)

中科院古脊椎與古人類所的高星敎授在2017年1月發表了《尋找我們的直系祖先——真相與謬誤》(http://mp.weixin.qq.com/s/Yb5N5ALqLxK_jC6WL4C3Vg )一文,對現代中國人的起源問題作出了深刻的探討,且對近年來攷古學及分子人類學在人類演化方面的進展作了詳細的梳理。我作爲復旦大學現代人類學實驗室的後輩科硏人員,謹代表個人,從分子人類學的角度對高敎授的觀點提出一些探討和補充。希望大家摒棄學科與門戶之見,綜合各方的證據,攜手探究人類演化史的眞相。而爭論幾年前證據不足時誰對誰錯並沒有必要,因爲科硏工作者都不是神仙,每個人發表看法時也只能基於自己看到的證據作出當時合乎自己知識和邏輯的推理。我希望分子人類學和
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y染色體

男性

分类: 人類學雜記
這是我在微博問答裏面收到的問題:

“人类男性的Y染色体在不断衰减,XX又不能繁殖后代,人类以后不是要绝种了?Y染色体为什么会衰减,还要多久会完全消失,在这之前人类能找到新的繁殖方法吗?”

我的回答如下(本文在原答案的基礎上又有所修正和補充):

首先,人類的 Y 染色體“不斷衰減”就不是個事實,因爲有修復機制。(之所以這個謬論被傳得這麼火,我懷疑是和部分女權主義人士有關。)此外,就算 Y 染色體徹底衰減掉,也是有辦法有雄性的。

Y 染色體本身結構非常複雜,​全長約 60 Mbp,除掉兩端共約 2.5 Mbp 的和 X 染色體連鎖的僞常染色體區段(pseudoautosome)以外,即非重組區(non-recombining region),其中一大半是高度重複的異染色體質(heterochromatin),​​其餘一半眞染色質(euchromatin)部分的近半區域也都是 2、3、4、6次之類的重複片段,在整個 Y 染色體中只出現一次的片段只有 10 Mbp 左右。Y 染色體上的基因很少,在 100 這個數量級上,準確數量不太容易算,有一些假基因,因爲生存必要的基
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杂谈

​我從去年夏天起已經不在復旦做收費抽血測試了,那以後都是建議去源基因 www.yoogene.com 測,我在復旦就能安心科硏了。但我會負責源基因結果質量的準確性和最終解讀。


源基因目前已經推出了Y染色體父系標準版測試,包含了24個Y-STR及1800個左右個Y-SNP,(相比之前我在復旦做的是17個STR和900個左右SNP),能把Y染色體至少分500多不同的類別,價格是999元(之前我在復旦時是1200元),郵寄唾液過去就可以,不用抽血。目前還是pdf報告,以後會能通過网站登錄來瀏覽按最新樹形的分類結果。


爲了感謝之前支持我科硏工作的受試者,不論參加的是否收費測試,都可聯繫我 ychr.fudan@gmail.com (用發結果的郵箱或其它能確定本人身份的途徑)獲得200元源基因標準版優惠碼,限每個老用戶一個碼,碼可以轉讓,2017年3月底前有效。


(在源基因標準版推出前的源基因父系基礎版(只測了Y-STR的)的老客戶請聯繫源基因的客服,好像是補差價升級到標準版就行。不是找我,我只管解答客服回答不了的知識性的疑難問題。以後的基礎版客戶好像就不能升級,只能重新買標準版服務了。)


另外, @

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