加载中…
个人资料
polyhedron
polyhedron 新浪个人认证
  • 博客等级:
  • 博客积分:0
  • 博客访问:587,716
  • 关注人气:1,492
  • 获赠金笔:0支
  • 赠出金笔:0支
  • 荣誉徽章:
博文
标签:

y染色體

單倍羣

突變

父系

分类: 人類學雜記

我集合了一些最近測試的Q-M242支系的全序列,包括復旦和源基因捕獲測試的Y染色體高通量數據、公開可得的一些數據(比如1000Genomes)和一些在別的機構測試上傳到源基因的bam,計算並細化了Q單倍羣的樹形。更新的樹形(含部分重要節點的共祖年代)見源基因网站 https://yoogene.com/goods/yfullreport 裏面的“Y染色體樹”。


标签:

語言

y染色體

線粒體

語音

分类: 人類學雜記
終於在學術雜誌上又發出了一篇我有重要參與的文章,文章已經確定被NSR(National Science Review,中國《國家科學評論》)接收。文章的作者都是復旦大學金力院士團隊的,包括金院士,還有張夢翰、我和鄭鴻翔三個博士。文章的主筆人是張夢翰博士,他是數學背景出身,統計學功底很好,在潘悟雲敎授門下讀了語言學的博士,畢業以後又到了現代人類學實驗室作了博後。我是主要做Y染色體的,同時也是語言學愛好者。而鄭鴻翔博士是線粒體方面的專家。硏究人類歷史,語言和遺傳都是重要的硏究材料,我們這樣一個團隊也就正好湊夠了人來硏究,人類的語言和遺傳到底有什麼樣的關聯。

我們的文章鏈接在這裏:http://dx.doi.org/10.1093/nsr/nwy083
中文新聞稿在這裏: http://life.fudan.edu.cn/Data/View/3079
标签:

y染色體

男性

分类: 人類學雜記
這是我在微博問答裏面收到的問題:

“人类男性的Y染色体在不断衰减,XX又不能繁殖后代,人类以后不是要绝种了?Y染色体为什么会衰减,还要多久会完全消失,在这之前人类能找到新的繁殖方法吗?”

我的回答如下(本文在原答案的基礎上又有所修正和補充):

首先,人類的 Y 染色體“不斷衰減”就不是個事實,因爲有修復機制。(之所以這個謬論被傳得這麼火,我懷疑是和部分女權主義人士有關。)此外,就算 Y 染色體徹底衰減掉,也是有辦法有雄性的。

Y 染色體本身結構非常複雜,​全長約 60 Mbp,除掉兩端共約 2.5 Mbp 的和 X 染色體連鎖的僞常染色體區段(pseudoautosome)以外,即非重組區(non-recombining region),其中一大半是高度重複的異染色體質(heterochromatin),​​其餘一半眞染色質(euchromatin)部分的近半區域也都是 2、3、4、6次之類的重複片段,在整個 Y 染色體中只出現一次的片段只有 10 Mbp 左右。Y 染色體上的基因很少,在 100 這個數量級上,準確數量不太容易算,有一些假基因,因爲生存必要的基
标签:

攷古

古dna

分子人类学

姓氏

皇族

分类: 人類學雜記

(溫馨提示:簡化字版本見後。)

嚴實(復旦大學現代人類學敎育部重點實驗室)

 

新浪微博 @polyhedron

我們做分子人類學,就是通過DNA瞭解人和人之閒生物學屬性的關係。其中Y

分类: 人類學雜記
之前我寫過《人類學雜記——23. 回族的Y染色體》(http://blog.sina.com.cn/s/blog_465ddf790101eoha.html),大體結論已經在裏面了,現在國內的回族數據又多積累了一些,大概公開一下結果,見餅圖。

因爲回族在全國分佈不均勻,且我這裏測過的樣本仍不是很多,採的也不勻,本文還是把回族相互獨立樣本量較少的省份進行了合併統計。首先Y染色體的民族以測試者可追溯的父系的民族爲準,地域看祖父出生地,相互獨立樣本指的是相同來源(若無明確家譜,則以村爲單位且同姓)且測試出的STR結果很接近(一般是0~3/17個STR的差別)的所有只按一份樣本統計。



結果如圖。雖然樣本量還不是太大,因此統計誤差也會比較大,但從西北到東部,父系的西方來源比例明顯是逐漸降低的,陝甘青新的回族有近一
标签:

緬甸

緬甸語

漢藏語系

y染色體

民族

分类: 人類學雜記
緬甸是一個聯邦制國家,民族衆多。

★地理篇★

(地圖來自維基百科,補了一條線)

按照緬甸官方的行政區劃,緬甸聯邦共和國目前包括7個省、7個邦和1個聯邦特區(首都內比都)。7個省以緬族爲主,包括中部的實皆省、曼德勒省、馬圭省、勃固省、仰光省、伊洛瓦底省及東南方的德林達依省。7個邦爲少數民族集中區,包括西部的欽邦、若開邦和東部的克欽邦、撣邦、克耶邦、克倫邦和孟邦。大體上,省分佈在海拔較低的平原地區,而邦在山地爲多。除這些政區,還有一些自治特區,比如果敢、佤邦等(這兩個在官方的撣邦裏,緊鄰中國)。另外,緬甸又分爲北部的上緬甸(伊洛瓦底江上游的曼德勒省、馬圭省、實皆省)和南部的下緬甸(仰光省、伊洛瓦底省、勃固省)。

标签:

y染色體

清朝

滿族

愛新覺羅

人類學雜記

分类: 人類學雜記
(溫馨提示:簡化字版本見後)

經過3年多樣本的積累,終於能夠對愛新覺羅皇族的Y染色體做一個定論了。這是我寫的《愛新覺羅皇族的Y染色體》。分了中英文兩個版本,因爲學界有不能一稿多投的規矩,我們決定英文仍去投正式的同行評審刊物,而中文的就直接發blog了。

英文版目前仍在投雜誌,但已經把草稿上載到文獻數據庫arXiv上,今天公開出來了。下載地址:http://arxiv.org/abs/1412.6274 或 http://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/1412/1412.6274.pdf 。需要注意的是,這個文章目前仍未通過同行評審,最終在一個學術刊物上發出的版本會與此有進一步修改。

中文版從基本數據上與英文版沒有區別,但略少了一些專業分析,略多了一些科普性的段落。我也放在微盤上分享了,下載地址: http://vdisk.weibo.com/s/qGPNPvCnab2w 
标签:

y染色體

線粒體

父系

母系

相親

分类: 人類學雜記
大家好,“庸俗的人類學”第二彈來了!(前一篇是好久之前的《Y染色體型與性格》了。)看不慣傳統漢字的可以找後邊的分隔線,下面有簡體。

爲什麼需要庸俗的人類學呢?因爲各種庸俗沒用胡撦的東西是人類相互勾搭的基礎。比如星座、血型,不會有幾個男生眞信這些,但好多女生認這些。博主因爲太科學了,大衆娛樂的東西基本沒碰過(動畫片算麼?),也不善於搭訕,平時在實驗室接觸的女人也就那麼幾個(誰讓你測Y染色體成天只給男人抽血!)。但攪科硏的人也是人,也有七情六慾,也有獻出祖傳的染色體的需求。(……)博主雖然出身不好(家裏一堆臭老九),但也出國讀過書,能用若干種語言唱歌,騎過川藏。老大不小的了家裏催得挺急,自己也挺鬱悶的。。。(喂,我要看的好像不是徵婚廣告吧?)

好,我先打住,說正題。總歸星座、血型那些太不科學了!好在血
标签:

線粒體

母系

dna

鄭鴻翔

漢族

分类: 人類學雜記
最近拿到一批實驗室內部的線粒體數據,統計結果挺有意思,拿出來和大家分享一下。主要工作由鄭鴻翔博士完成。

首先還是先讓大家熟悉一下線粒體(母系)樹的結構。線粒體的命名從大規則上跟Y染色體類似,也是大寫拉丁字母打頭,後面數字和小寫字母間隔,如M7a1a之類。但線粒體的命名從來沒有像Y染色體那樣開過國際大會,而是根據傳統逐漸添加的,所以有諸多混亂的地方。各單倍羣的分佈見http://blog.sina.com.cn/s/blog_465ddf7901010f1b.html ,本文不多作重複。

大體上是這樣:靠近根部的,絕大多數非洲的類型是L,最早分出的是L0支系。走出非洲的所有支系的共祖是L3,其中M和N是走出非洲的兩大支,N下面的主體稱作R。除L M N R外,其餘的大寫拉丁字母都是相對小的支系,屬於M N R之下。主要是開始命名時先做的美洲土著,命名成了A B C D(其實這幾支在東亞、中國都有),然後把其他發現的亞洲、歐洲的支系分別從字母序的兩頭分別向中閒命名,最後剩下的就是L M N了。而且很多字母單倍羣之閒又有包含關係,比如C和Z包含在M
标签:

str

法醫

親子鑑定

疾病

基因

分类: 人類學雜記
(溫馨提示:簡化字版本見後。)

曾經在做曹操家族Y染色體時,就看到有這樣的評論,說國外的科學家都是向着未來,硏究怎麼治病、增產、改造人類,就中國的科學家只往回看祖先,你們做這事兒有什麼意義(大意,原話我忘了)。

首先,國外的人也對找祖先、尋根很感興趣,也有很多公司和硏究單位在從事這方面的工作,同時中國相當多的科學家也在做面向未來的硏究。瞭解古代和發展未來都是必要的,不可偏廢。所謂以史爲鑑,歷史經驗能爲今後發展提供很多重要的參攷,使社會少走彎路。如果回溯歷史不重要,那歷史學和攷古學乾脆都解散算了。之前這裏我也回答過一些,http://blog.sina.com.cn/s/blog_465ddf790101gis0.html ,包括《复旦大学研究曹操的DNA有什么意义?》和《如果曹操的后代中间有人喜当爹,DNA的研究结果会不会没意义?》,也不在此重複講了。這裏再補充說一些分子人類學
  

新浪BLOG意见反馈留言板 欢迎批评指正

新浪简介 | About Sina | 广告服务 | 联系我们 | 招聘信息 | 网站律师 | SINA English | 产品答疑

新浪公司 版权所有