十足的菜鸟一只，刚接触gromacs没几天，只会了一点皮毛的东西，但是从完全不会到会了皮毛，也足够使某只菜鸟乐颠颠了～～！
    学的时候，参照了分子模拟论坛里很多内容，但发现大多都建立在懂linux的基础上（说错了咩？我真滴是这样理解滴。。。），虽然看了，可我还是不知道从何入手，就像一个完全不懂电脑的人，你让他用word写篇文，首先得告诉他怎样开电脑，怎样找到word，怎样打开word，又怎样切换到中文输入法才可以吧？于是，决定写篇入门小总结，留个纪念。

一、分子模拟一般步骤：
1、选软件：根据目标、所需力场决定。
  “目标”：查阅相关文献，看文献中用这个软件干了什么，得出了什么样的结果，而这些作用和结果对于自己是否适用。简单地说，即为寻找相似度。
2、具体模拟时：
（1）输入文件。文件中包含初始坐标、条件等。
     参数文件。描述力场等。
     体系大小。由选用的box大小决定，box的大小依据具体题目要求设置。
（2）能量最小化。去除接触应力。
（3）平衡模拟。要在平衡条